{"id":9592,"date":"2021-01-05T23:23:28","date_gmt":"2021-01-06T04:23:28","guid":{"rendered":"https:\/\/nebula.org\/blog\/genom\/"},"modified":"2021-02-20T20:23:47","modified_gmt":"2021-02-21T01:23:47","slug":"genom","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/nebula.org\/blog\/de\/genom\/","title":{"rendered":"Genom &#8211; Der Code des Lebens in allen lebenden Organismen"},"content":{"rendered":"\n<h2 class=\"wp-block-heading\" id=\"h-what-s-a-genome\"><strong>Was ist ein Genom?<\/strong><\/h2>\n\n<p>Das Genom ist das gesamte Material, das die Erbinformation einer Zelle oder eines Viruspartikels enth\u00e4lt. Es existiert als Chromosomen,<a href=\"https:\/\/nebula.org\/blog\/de\/dna-desoxyribonukleinsaeure\/\"> DNA<\/a> oder RNA im Fall von RNA-Viren. In einem abstrakten Sinne umfasst dies auch die Gesamtheit der Erbinformationen eines Individuums.<\/p>\n\n<p>Der Begriff \u201eGenom\u201c wurde 1920 von Hans Winkler gepr\u00e4gt. Die Genomforschung untersucht normalerweise strukturelle Variationen und die Wechselwirkungen zwischen diesen<a href=\"https:\/\/nebula.org\/blog\/de\/gene\/\"> Gene<\/a> .<\/p>\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img decoding=\"async\" width=\"1024\" height=\"610\" src=\"https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome1-1024x610.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-3069\" title=\"Menschliches Genom zu Genen\" srcset=\"https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome1-1024x610.png 1024w, https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome1-300x179.png 300w, https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome1-768x457.png 768w, https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome1-16x10.png 16w, https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome1.png 924w\" sizes=\"(max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/><figcaption>Das menschliche Genom ist in Chromosomen angeordnet, die DNA-Sequenzen enthalten, die Gene enthalten. Quelle:<a href=\"https:\/\/commons.wikimedia.org\/wiki\/File:Human_genome_to_genes-it.png\"> LoStrangolatore \/ CC BY 3.0<\/a><\/figcaption><\/figure>\n\n<figure class=\"wp-block-table\"><table class=\"has-subtle-pale-pink-background-color has-background\"><tbody><tr><td><a href=\"https:\/\/nebula.org\/whole-genome-sequencing\/\"><strong>M\u00f6chten Sie 100% Ihrer DNA entschl\u00fcsseln? Nebula Genomics bietet die g\u00fcnstigste Sequenzierung des gesamten Genoms! Beginnen Sie eine lebenslange Entdeckung mit uneingeschr\u00e4nktem Zugriff auf Ihre Genomdaten, w\u00f6chentlichen Aktualisierungen auf der Grundlage der neuesten wissenschaftlichen Entdeckungen, erweiterten Ahnenanalysen und leistungsstarken Tools zur Erforschung des Genoms. 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Es gibt auch Pseudogene: Gene, die aufgrund von Mutationen funktionslos geworden sind und vom Organismus nicht mehr gelesen werden k\u00f6nnen.<\/p>\n\n<p>Neben der DNA im Zellkern befindet sich in anderen Teilen der Zelle weiteres genetisches Material. In Eukaryoten finden sich in den Mitochondrien (Mitogenom, auch Chondriom) eigene kleine Genomsequenzen. In Algen und Landpflanzen kommen sie fast immer in Chloroplasten und anderen Plastiden (Plastomen) vor. Prokaryoten (Bakterien und Archaeen) enthalten h\u00e4ufig zus\u00e4tzliche, relativ kurze, in sich geschlossene DNA-Molek\u00fcle, die als Plasmide bezeichnet werden.<\/p>\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\" id=\"h-organization-of-genomes\"><strong>Organisation von Genomen<\/strong><\/h2>\n\n<h3 class=\"wp-block-heading\" id=\"h-eukaryotes\"><strong>Eukaryoten<\/strong><\/h3>\n\n<p>Bei Eukaryoten besteht das Kerngenom (Karyom) aus mehreren bis zahlreichen strangartigen Chromosomen. Die Kern-DNA wird auch als Kern-DNA (nDNA) bezeichnet. Die Anzahl der Chromosomen ist speziesspezifisch und kann von zwei (beim Pferdewurm) bis zu mehreren hundert (bei einigen Farnen) variieren. <\/p>\n\n<p>Die Anzahl der Chromosomen \u00e4ndert sich auch, wenn sich die Kernphase \u00e4ndert (Meiose und Karyogamie). Eukaryontische Genome haben auch einen hohen Anteil an nicht-kodierender DNA und die Intron-Exon-Struktur in ihren Genen.<\/p>\n\n<h3 class=\"wp-block-heading\" id=\"h-prokaryotes\"><strong>Prokaryoten<\/strong><\/h3>\n\n<p>In Prokaryoten liegt die DNA als langes, in sich geschlossenes Molek\u00fcl vor. Dar\u00fcber hinaus k\u00f6nnen k\u00fcrzere, ebenfalls in sich geschlossene DNA-Molek\u00fcle, sogenannte Plasmide, in variabler Anzahl vorliegen. Diese k\u00f6nnen unabh\u00e4ngig von der Haupt-DNA amplifiziert und auch \u00fcber Speziesgrenzen hinweg an andere prokaryotische Zellen (Konjugation) weitergegeben werden. Sie enthalten in der Regel nur wenige Gene, die beispielsweise eine Antibiotikaresistenz vermitteln.<\/p>\n\n<p>Prokaryontische Genome sind im Allgemeinen viel kleiner als eukaryotische Genome. Sie enthalten relativ kleine nichtkodierende Teile (5-20%) und auch nur wenige oder keine Introns.<\/p>\n\n<h3 class=\"wp-block-heading\" id=\"h-organelles\"><strong>Organellen<\/strong><\/h3>\n\n<p>Die Genome der Mitochondrien, Plastiden und anderer Arten von Hydrogenosomen sind wie Prokaryoten organisiert. Nach der endosymbiotischen Theorie wird angenommen, dass diese Organellen fr\u00fcher als frei lebende Prokaryoten existieren. Diese &#8222;Mitogenome&#8220; und &#8222;Plastome&#8220; enthalten auch einen kleinen Teil der Gene, die f\u00fcr ihre eigene Funktion ben\u00f6tigt werden. Deshalb werden diese Organellen als &#8222;halbautonom&#8220; bezeichnet.<\/p>\n\n<h3 class=\"wp-block-heading\" id=\"h-viruses\"><strong>Viren<\/strong><\/h3>\n\n<p>Virale Genome sind sehr klein, da sie nur wenige Proteine enthalten. Die genetische Information ist stark verdichtet, da sich verschiedene Gene \u00fcberlappen. Einige Abschnitte k\u00f6nnen gleichzeitig auch als Gene in den Leserichtungen verschiedener Sequenzen fungieren. Das virale Genom (auch als Virom bekannt) kann<\/p>\n\n<ul class=\"wp-block-list\"><li>bestehen aus DNA oder RNA,<\/li><li>dies kann einzel- oder doppelstr\u00e4ngig sein,<\/li><li>linear oder kreisf\u00f6rmig geschlossen sein und<\/li><li>sind in mehrere Teile unterteilt (mehrteilig) oder unsegmentiert (einteilig)<\/li><\/ul>\n\n<p>Eine Besonderheit sind Retroviren. Ihr RNA-Genom kann durch reverse Transkription in DNA &#8222;\u00fcbersetzt&#8220; und in das Wirtsgenom integriert werden. Die Eigenschaften der Genome der Viren sind wichtige Kriterien f\u00fcr ihre Klassifizierung.<\/p>\n\n<p>Einige Viren und insbesondere Virophagen (Viren, die andere Viren angreifen) haben mobile genetische Elemente (Transposons, Transpovirons, Polintons). Im Allgemeinen wird ihre Gesamtheit auch als Mobilom bezeichnet.<\/p>\n\n<h3 class=\"wp-block-heading\" id=\"h-viroids\"><strong>Viroide<\/strong><\/h3>\n\n<p>Die genomische RNA von Viroiden ist kurz. Es erstreckt sich zwischen 241 und 401 Nukleotiden und enth\u00e4lt viele komplement\u00e4re Regionen, die doppelstr\u00e4ngige Sekund\u00e4rstrukturen bilden. Viroide haben keine zus\u00e4tzliche H\u00fclle und sind 80- bis 100-mal kleiner als die kleinsten Viren. Sie vermehren sich in lebenden Zellen h\u00f6herer Pflanzen.<\/p>\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\" id=\"h-genome-sizes\"><strong>Genomgr\u00f6\u00dfen<\/strong><\/h2>\n\n<p>Die Genomgr\u00f6\u00dfe ist die Menge an DNA, die in einem Genom vorhanden ist. Bei Eukaryoten bezieht sich diese Information normalerweise auf den haploiden Chromosomensatz, der auch als C-Wert bezeichnet wird. Es wird entweder die Anzahl der vorhandenen Basenpaare (bp) oder die DNA-Masse in der Einheit pg (Pikogramm) angegeben. <\/p>\n\n<p>Ein pg doppelstr\u00e4ngiger DNA besteht aus etwa 0,978-109 bp, dh fast einer Milliarde Basenpaaren. Verschiedene Organismen<a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/6800981\"> haben unterschiedliche Pikogramme zu Basenpaarverh\u00e4ltnissen<\/a> Trotzdem sind die beiden Einheiten nicht immer leicht zu vergleichen.<\/p>\n\n<p>Mit der Leichtigkeit von<a href=\"https:\/\/nebula.org\/blog\/de\/dna-sequenzierung\/\"> Genomsequenzierung<\/a> In den letzten zehn Jahren wurde h\u00e4ufiger die Genomgr\u00f6\u00dfe in Basenpaaren gemessen. Um 1.000 Basenpaare zu summieren, wird \u00fcblicherweise der Begriff &#8222;Kilobasenpaare&#8220; (kbp oder kb) verwendet. F\u00fcr eine Million Basenpaare verwenden wir \u201eMegabasispaare\u201c (Mbp oder Mb).<\/p>\n\n<p>1972 wurde der \u00e4thiopische Lungenfisch (<em> Protopterus aethiopicus<\/em> ) wird oft als Wirbeltier mit dem gr\u00f6\u00dften Genom bezeichnet<a href=\"https:\/\/www.nature.com\/articles\/6800981\"> bei ungef\u00e4hr 133 pg<\/a> . Im Jahr 2014 wurde der Rekord von Heuschrecke gebrochen (<em> Locusta migratoria<\/em> ) mit<a href=\"https:\/\/www.sciencedaily.com\/releases\/2014\/01\/140116113556.htm\"> 6,3 Gbit \/ s<\/a> . Im Jahr 2018<a href=\"https:\/\/www.mpg.de\/11886639\/decoding-the-axolotl-genome\"> 32 Milliarden Basenpaare<\/a> wurden aus dem mexikanischen Axolotl nachgewiesen (<em> Ambystoma mexicanum<\/em> ).<\/p>\n\n<figure class=\"wp-block-image size-large\"><img decoding=\"async\" width=\"1024\" height=\"589\" src=\"https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome2-1024x589.jpg\" alt=\"\" class=\"wp-image-3070\" title=\"Mexikanischer Axolotl\" srcset=\"https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome2-1024x589.jpg 1024w, https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome2-300x173.jpg 300w, https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome2-768x442.jpg 768w, https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome2-1536x884.jpg 1536w, https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome2-16x9.jpg 16w, https:\/\/nebula.org\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/12\/genome2.jpg 924w\" sizes=\"(max-width: 1024px) 100vw, 1024px\" \/><figcaption>Der mexikanische Axolotl (<em> Ambystoma mexicanum<\/em> ) hat die j\u00fcngste Aufzeichnung des gr\u00f6\u00dften Genoms bei Wirbeltieren bei etwa 32 Gbit \/ s. Quelle:<a href=\"https:\/\/commons.wikimedia.org\/wiki\/File:Ke_-_Ambystoma_mexicanum_-_1.jpg\"> Em\u0151ke D\u00e9nes \/ CC BY-SA 4.0<\/a> .<\/figcaption><\/figure>\n\n<p>Der Blattfloh Endosymbiont<em> Carsonella ruddii<\/em> hat das kleinste quantifizierte Bakteriengenom<a href=\"https:\/\/www.nature.com\/news\/2006\/061009\/full\/news061009-10.html\"> in 2006<\/a> . Sein zirkul\u00e4res DNA-Molek\u00fcl enth\u00e4lt nur etwa 160.000 Basenpaare, die alle Informationen enthalten, die es zum Leben ben\u00f6tigt.<\/p>\n\n<p>Die DNA einer einzelnen menschlichen Zelle ist aneinandergereiht etwa 1,80 m lang. Theoretisch hat ein Basenpaar einen Informationsgehalt von 2 Bits, da es 4 Zust\u00e4nde annehmen kann (A \/ T \/ G \/ C). Mit ungef\u00e4hr 3,27 Milliarden Basenpaaren w\u00fcrde sein maximaler Informationsgehalt 6,54 Milliarden Bits oder 780 MiB betragen. <\/p>\n\n<p>Der tats\u00e4chliche Informationsgehalt ist vermutlich geringer, da gro\u00dfe Teile der DNA nichtkodierende Sequenzen mit partiellen regulatorischen Funktionen enthalten. Laut dem<a href=\"https:\/\/www.genome.gov\/human-genome-project\/results\"> Ergebnisse des Humangenomprojekts<\/a> 2003 enthielten 99,99% des menschlichen Genoms Gene.<\/p>\n\n<p>Es besteht ein Mangel an Korrelation zwischen der Genomgr\u00f6\u00dfe und der Komplexit\u00e4t des Organismus oder dem &#8222;C-Wert-Paradoxon&#8220;. Zum Beispiel haben Caudate ein gr\u00f6\u00dferes Genom als Reptilien, V\u00f6gel und S\u00e4ugetiere. Lungenfische und Knorpelfische haben ein gr\u00f6\u00dferes Genom als echte Knochenfische. Innerhalb von Bl\u00fctenpflanzen oder Protozoen variiert die Genomgr\u00f6\u00dfe jedoch erheblich. <\/p>\n\n<p>Die gr\u00f6\u00dfte Menge an DNA findet sich in einfachen Eukaryoten wie Am\u00f6ben und Urfarnen. Diese Organismen haben ungef\u00e4hr eine Billion Basenpaare. Ihr Genom enth\u00e4lt auch einzelne Gene als tausendfache Kopien und lange nicht proteinkodierende Abschnitte.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Was ist ein Genom? Das Genom ist das gesamte Material, das die Erbinformation einer Zelle oder eines Viruspartikels enth\u00e4lt. Es existiert als Chromosomen, DNA oder RNA im Fall von RNA-Viren. 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