كيفية استخدام GEDmatch – البرنامج التعليمي الكامل للعثور على الأقارب

مقدمة GEDmatch

GEDmatch هو موقع مجاني في الأساس لعلم الأنساب يتيح للمستخدمين تحميل نتائج اختبار الحمض النووي الوراثي الخاصة بهم والعثور على الأفراد ذوي الصلة. أسسها كورتيس روجر في عام 2010. أداة GEDmatch Genesis القوية تجد أجزاء مطابقة من الحمض النووي في 1.3 مليون مستخدم بغض النظر عن الشركة التي تأتي منها البيانات الأصلية. يمكن للمستخدمين تحميل البيانات من مجموعة متنوعة من المواقع ، مما يسمح للأشخاص بالعثور على أفراد العائلة حتى لو استخدم أحدهم 23andMe والآخر استخدم AncestryDNA. هناك أيضًا أدوات أخرى للحمض النووي تتيح لك استكشاف أسلافك.

أحد العوائق الرئيسية لتطبيق GEDmatch هو أنه غير مصمم للمستخدم المبتدئ. هذا هو الغرض من هذا البرنامج التعليمي: سنرشدك إلى كيفية التسجيل مجانًا ، وتحميل بيانات الحمض النووي الخام الخاصة بك من مواقع اختبار الحمض النووي الأخرى ، وكيفية النظر إلى أسلافك ، واستكشاف علاقاتك العائلية.

هل أنت مهتم بفك تشفير 100٪ من الحمض النووي الخاص بك للحصول على نتائج أسلاف أكثر دقة والمزيد من تطابق الحمض النووي مع الأقارب؟ تقدم Nebula Genomics اختبار DNA لتسلسل الجينوم الكامل مقابل 299 دولارًا فقط! انقر هنا لمعرفة المزيد!

هل GEDmatch آمن؟

لن تعطيك GEDmatch معلومات طبية غير دقيقة قد تتسبب في طلب الرعاية الطبية بالخطأ لأنها لن تقدم لك أي معلومات طبية أو صحية على الإطلاق. كما أنه لا يصف نفسه بأنه أكثر المقاييس دقة ودقة للعرق. تقوم أدوات المزج / التراث بسحب البيانات من العديد من المصادر المختلفة وستختلف نتائجك حسب المشروع الذي تختاره.

قبل أن تبدأ في تحميل بياناتك الجينية إلى مواقع عشوائية ، يجب أن تعرف المزيد عن من يتلقى تلك البيانات. GEDmatch مملوكة حاليًا لشركة Verogen ، وهي شركة متخصصة في علم الجينوم الجنائي. تجني شركة Verogen الأموال ، جزئيًا ، من خلال السماح لأجهزة إنفاذ القانون باستخدام قاعدة بيانات الأنساب لحل الجرائم. قد يعني هذا أن الحمض النووي الخاص بك يمكن أن يساعد في التعرف على ضحية الجريمة – أو المجرم.

كيفية التسجيل

التسجيل مباشر. اذهب إلى صفحة التسجيل واملأ اسمك واسمك المستعار إذا كنت تفضل عدم ظهور اسمك علنًا والبريد الإلكتروني وكلمة المرور. سيكون بريدك الإلكتروني وكلمة المرور بمثابة تسجيل دخول GEDmatch.

يجب أن يكون البريد الإلكتروني صالحًا لأن GEDmatch سيرسل رمز التحقق. اعلم أن هذا البريد الإلكتروني سيكون مرئيًا للمستخدمين الآخرين إذا اخترت استخدام الأداة المركزية لمطابقة الحمض النووي من شخص إلى متعدد. على الرغم من طلب اسمك الحقيقي ، لا يبدو أنه تم التحقق من صحته.

تتطلب صفحة تسجيل مستخدم GEDmatch بريدًا إلكترونيًا يمكن للمستخدمين الآخرين رؤيته.
تتطلب صفحة تسجيل مستخدم GEDmatch بريدًا إلكترونيًا يمكن للمستخدمين الآخرين رؤيته.

كيفية تحميل البيانات إلى GEDmatch

لا يقدم GEDmatch اختبار الحمض النووي ، فقط تفسير نتائج الحمض النووي الموجودة. لذلك ، سوف تحتاج إلى تنزيل بياناتك من أي شركة اختبار تعتمد على SNP قمت بإرسال عينة إليها. يمكنك إما البحث عن “كيفية تنزيل البيانات الجينية الأولية من” واسم شركة الاختبار الخاصة بك أو الانتقال مباشرة إلى البرامج التعليمية من أصل الحمض النووي ، 23 وأنا ، أو DNA شجرة العائلة .

بناءً على مكان إجراء الاختبار ، يمكنك تنزيل ملف واحد أو مجلد. من المحتمل أن يكون هذا “مضغوطًا” مما يجعله يشغل مساحة أقل ولكنه يجعله لا يتمكن من قراءته إلا الكمبيوتر. لفك ضغطه ، وجعله قابلاً للقراءة من قبل الإنسان ، على جهاز Mac ، انقر عليه نقرًا مزدوجًا أو انقر بزر الماوس الأيمن على الكمبيوتر الشخصي وانقر على “فك الضغط”. يمكنك الآن فتحه في WordPad أو Excel.

لن يقبل GEDmatch إلا ما يسميه “تنسيق 23andMe”. هذا يختلف عن “تنسيق المكالمة المتغيرة” أو “VCF”. لن يقبل GEDmatch ملفات .vcf. من المحتمل أن تتمكن من تنزيل ملف بتنسيق 23andMe مباشرةً. إذا كنت قادرًا فقط على تنزيل VCF ، فتحقق من ذلك هذا البرنامج التعليمي (قم بالتمرير لأسفل إلى الجزء بعنوان “تحويل ملفات VCF إلى ملفات 23andMe”).

لن يقبل GEDmatch الإكسومات أو الجينومات الكاملة. يوصون أيضًا بعدم تحميل البيانات المنسوبة حيث حاول الكمبيوتر تخمين ما قد يكون الحمض النووي الخاص بك بين SNPs التي تم اختبارها بالفعل. يجب عليك تحميل بيانات SNP الأولية فقط.

سيتحقق GEDmatch مما إذا كان الملف بالتنسيق الصحيح ويرفضه إذا لم يكن كذلك. إذا كنت تريد التحقق من أن الملف بتنسيق 23andMe بنفسك ، يمكنك فتحه في Wordpad أو Excel. من المحتمل أن تحتوي على بعض الأسطر في الجزء العلوي التي تبدأ بعلامة تصنيف ، يتجاهلها الكمبيوتر. سيبدو الباقي كما يلي:

# التركيب الجيني لموضع الكروموسوم rsid

rs3094315 1 752566 AA

rs3131972 1 752721 GA

rs75333668 1 762320 CC

rsID هو اسم SNP ، والكروموسوم ، والموضع حيث يوجد SNP ، والنمط الجيني هو ما هو SNP في هذا الموضع. هناك حرفان ، واحد من كل والد.

الآن ، يمكنك تحميل المعلومات الجينية الخاصة بك على GEDmatch. يوجد هذا الزر على الجانب الأيمن من الصفحة الرئيسية ، وتم تمييزه في المربع الأحمر أدناه ، ويقول “التحميلات العامة (23andMe و FTDNA و AncestryDNA و Living DNA ومعظم الآخرين)”.

على الجانب الأيمن من الصفحة الرئيسية لـ GEDmatch يوجد الفهرس الذي يتضمن رابطًا لتحميل ملفات الحمض النووي الخاصة بك.
على الجانب الأيمن من الصفحة الرئيسية لـ GEDmatch يوجد الفهرس الذي يتضمن رابطًا لتحميل ملفات الحمض النووي الخاصة بك.

في الصفحة التالية ، يوصى بملء أكبر قدر ممكن من المعلومات لديك. ومع ذلك ، فإن المربعات الضرورية الوحيدة هي الاسم وأنك تنقر على زر الاختيار الذي يوضح أنك مخول بتحميل البيانات (لأنها ملكك ، أو لديك إذنهم ، أو الشخص ميت ، أو أنك مسؤول عن تطبيق القانون). كل شيء آخر اختياري. إذا كنت لا تعرف الإجابة ، فاتركها فارغة.

يجب أن يكون لدى مستخدم GEDmatch التفويض المناسب لتحميل بيانات الحمض النووي إلى GEDmatch.
يجب أن يكون لدى مستخدم GEDmatch التفويض المناسب لتحميل بيانات الحمض النووي إلى GEDmatch.

المجموعة الأخيرة من الأسئلة اختيارية ولكن من المهم الإجابة عليها. هذا يطلب تفضيلات الخصوصية لملف تعريف DNA هذا ، والذي يسمى أيضًا “مجموعة DNA”.

الخيار الافتراضي هو “Opt-in” والذي سيسمح لتطبيق القانون بالوصول إلى بياناتك لعمليات البحث الإجرامية. من المهم أن نلاحظ أن GEDmatch قد تم استخدامه لتحديد المجرمين من خلال العثور حتى على أفراد الأسرة ذوي الصلة البعيدة. تم استخدام GEDmatch لحل قضية Golden State Killer الباردة عن طريق مطابقة الحمض النووي من مسرح الجريمة إلى ابن عم ثالث أو رابع.

اخترت “إلغاء الاشتراك” الذي يتيح لي مقارنة مجموعة أدواتي مع الآخرين ويسمح للأفراد الذين ليسوا من جهات إنفاذ القانون بالعثور علي. تشمل الخيارات الأخرى البحث ، الذي يتيح لك رؤية التطابقات ولكن لا يسمح للمطابقات برؤيتك ، أو خاص ، والذي لن يسمح لك بالعثور على أفراد العائلة باستخدام أداة Genesis ولكنه سيسمح لك باستخدام أدوات النسب الأخرى.

حتى إذا قمت بإلغاء الاشتراك أو اخترت الاحتفاظ بخصوصية البيانات ، فسيظل GEDmatch يحول البيانات إلى تطبيق القانون إذا أمرت المحكمة باستدعاء المعلومات.

يمكن لمستخدمي GEDmatch إلغاء الاشتراك في استخدام الحمض النووي الخاص بهم في عمليات البحث التي تقوم بها سلطات تطبيق القانون ، ويظل مرئيًا للمطابقات العائلية المحتملة.
يمكن لمستخدمي GEDmatch إلغاء الاشتراك في استخدام الحمض النووي الخاص بهم في عمليات البحث التي تقوم بها سلطات تطبيق القانون ، ويظل مرئيًا للمطابقات العائلية المحتملة.

انقر فوق “اختيار ملف” ، وابحث عن الملف على جهاز الكمبيوتر الخاص بك ، ثم انقر فوق “تحميل”. بمجرد إضافة ملفك ، قد يستغرق الأمر عدة دقائق حتى يتم التحميل. لا تترك الصفحة أو تضغط على تحديث. سيعتمد الوقت على حجم ملف بيانات الجينوم ومدى جودة سرعات التحميل لديك. إذا استغرق الأمر أكثر من عشر دقائق ، يجب أن تحاول مرة أخرى.

إذا كان الملف كبيرًا جدًا وبطيئًا في التحميل ، يمكنك إعادة ضغطه. في نظام التشغيل Mac ، اضغط على ctrl مع النقر على اسم الملف وحدد “ضغط”. على جهاز الكمبيوتر ، انقر بزر الماوس الأيسر ، وحدد “إرسال إلى” وحدد “مجلد مضغوط (مضغوط)”.

سترى بعد ذلك بعض الأرقام الخضراء الكبيرة قيد العد ، والتحقق من العثور على كل من الكروموسومات الخاصة بك في ملفك ، ومن ثم ستعطيك “رقم المجموعة”. ستحتاج إلى هذا لجميع التحليلات على GEDmatch. لا تقلق كثيرًا بشأن كتابتها في مكان آمن ، فستظهر على الصفحة الرئيسية ويمكنك نسخها ولصقها من هناك.

لا يمكن للمستخدم العودة إلى الصفحة الرئيسية لـ GEDmatch دون التأكد من فهمهم أن أداة واحد لأكثر لن تكون متاحة لمدة 24-48 ساعة.
لا يمكن للمستخدم العودة إلى الصفحة الرئيسية لـ GEDmatch دون التأكد من فهمهم أن أداة واحد لأكثر لن تكون متاحة لمدة 24-48 ساعة.

من أجل العودة إلى الصفحة الرئيسية ، ستحتاج إلى الإجابة على سؤال GEDmatch ، “متى ستتوفر مجموعة أدواتي لأداة واحد إلى متعدد؟” مع “عادة في غضون 24 إلى 48 ساعة”. هذه هي استراتيجية GEDmatch لمنعك من إرسال بريد إلكتروني إليهم والسؤال عن سبب عدم العثور على نتائجك حتى الآن.

يستغرق تشغيل أداة GEDmatch الفردية بعض الوقت لأنه يتعين عليها مقارنة الحمض النووي الخاص بك بالحمض النووي لجميع المستخدمين البالغ عددهم 1.3 مليون مستخدم. لا تقلق ، رغم ذلك ، هناك أدوات أخرى يمكنك اللعب بها أثناء الانتظار.

كيف تنظر إلى المزيج / التراث الخاص بك

سيحتاج المستخدم إلى رقم المجموعة الخاص به (الصندوق الأخضر) لاستخدام أداة الخلط (المربع الأحمر).
سيحتاج المستخدم إلى رقم المجموعة الخاص به (الصندوق الأخضر) لاستخدام أداة الخلط (المربع الأحمر).

لإلقاء نظرة على Admixture (التراث) الخاص بك ، ستحتاج إلى العثور على رقم طقمك. تم تمييز المنجم في المستطيل الأخضر على اليسار أعلاه. يمكنك تدوين هذا أو نسخه فقط للصقه لاحقًا. ثم ، انقر فوق “مزيج (تراث)” على يمين الشاشة.

يعمل تحليل الخلط عن طريق مطابقة أجزاء من تعدد الأشكال الخاص بك بمجموعة من المراجع. من المهم أن تقارن بالمجموعة الصحيحة من المراجع. خلاف ذلك ، قد يحاول البرنامج فرض تطابق غير دقيق في الواقع ، ولكنه أقرب ما يكون إليه ، ويفقد أي مباراة كان من الممكن أن يقوم بها.

مشروع GEDmatch MDLP هو آلة حاسبة عالمية واسعة جيدة لمعظم المستخدمين.
مشروع GEDmatch MDLP هو آلة حاسبة عالمية واسعة جيدة لمعظم المستخدمين.

جدول البيانات هذا يحتوي على قائمة شاملة لكل من السكان في كل مشروع.

MDLP جيدة كآلة حاسبة عالمية واسعة النطاق. إنها تسحب البيانات من جميع أنحاء العالم. MDLP world و MDLP world-22 مفيدان لأي شخص يرغب في إلقاء نظرة واسعة على أسلافهم. MDLp world-22 يتضمن Pygmy و West-Asian و North European Mesolithic (عينة DNA قديمة) ، Indo-Tibetan ، Mesoamerica ، Arctic-Amerind ، South-America_Amerind ، Indian ، North-Siberian ، Atlantic_Mediterannean_Neolithic ، Samoedic ، Indo_Iranian ، East-Siberian ، شمال شرق أوروبا ، جنوب إفريقيا ، شمال أمريكا ، جنوب الصحراء ، شرق وجنوب آسيا ، الشرق الأدنى ، الميلانيزي ، باليو سيبيريا ، والأسترونيزي.

يوروجين يوفر خريطة أدق لأوروبا مع Eurogenes EUtest V2 K15 بما في ذلك North_Sea و Atlantic و Baltic و Eastern_Euro و West_Med و West_Asian و East_Med و Red_Sea و Aouth_Asian و Southeast_Asian و Siberian و American Indian و Oceania و Northeast African و Sub-Saharan.

دوديكاد لديها عدد قليل من المجموعات المختلفة التي توفر تنوعًا جيدًا لأولئك الذين لديهم تراث أفريقي (Dodecad Africa9 مع أوروبا ، NW_Africa ، SW_Asia ، E_Africa ، Mbuti ، W_Africa ، Baika ، و San) ، أو التراث الآسيوي (Dodecad V3 مع الشرق_الأوروبي ، والغرب_الأوروبي ، والبحر الأبيض المتوسط ، و Neo_African و West_asian و South_Asian و Northeast_Asian و Southeast_Asian و East_African و Southwest_Asian و Northwest African و Palaeo_African).

HarappaWorld مستهدف من أصل جنوب آسيا ويتضمن S-Indian ، و Baloch ، و Caucasian ، و NE-Euro ، و SE-Asian ، و Siberian ، و NE-Asian ، و Papuan ، و American ، و Beringian ، و Mediterranian ، و SW-Asian ، و San (South African Hunter-Gatherers) و E-African و Pygmy و W-African.

Ethiohelix مستهدف لمن هم من أصل أفريقي مع Ethiohelix K10 Africa فقط التي تحتوي على Nilo-Saharan و East-Africa2 و Mbuti-Pygmy و East_Africa1 و Khoi-San و West_Africa و Hadza و Biaka-Pygmy و North-Africa و Omotic.

puntDNAL يسحب البيانات من الحمض النووي القديم ، مع puntDNAL K10 القديم بما في ذلك ASI (جنوب الهند القديمة) ، وجنوب الصحراء الكبرى ، وأوقيانوسيا ، و Beringian ، و END (المزارعون الأوائل من العصر الحجري الحديث) ، و CHG (Caucasus Hunter-Gatherers) ، و Siberian ، و E_Asian ) والهنود الحمر.

جيدروسيا يستخدم أيضًا الحمض النووي القديم مع Gedrosia Ancient Eurasia K6 بما في ذلك شمال أوراسيا الأسلاف ، وأسلاف جنوب أوراسيا ، وشرق آسيا ، وغرب أوروبا هنتر ، وناتوفيان ، وسوب الصحراء.

يمكن تصور نتائج الاختبار بعدة طرق ، بما في ذلك “النسب” التي تعطي مخططًا دائريًا ، أو “الاختلاط بالكروموسوم” والذي يتضمن معلومات حول أجزاء الكروموسومات التي تم تحديدها على أنها قادمة من كل منطقة.

يتم عرض نتائج خليط GEDmatch MDLP World-22 كنسب.
يتم عرض نتائج خليط GEDmatch MDLP World-22 كنسب.
يتم عرض نتائج خليط GEDmatch MDLP World-22 على هيئة طلاء كروموسوم.
يتم عرض نتائج خليط GEDmatch MDLP World-22 على هيئة طلاء كروموسوم.

يعد المخطط الدائري مفيدًا لمعرفة تقديرات أسلافك الإجمالية. تسمح لك لوحة الكروموسوم بمعرفة أي مناطق من الجينوم تنتمي إلى أي مجموعة وتساعد في إظهار قدر أكبر قليلاً من عدم اليقين في التقديرات – قد تأتي المناطق ذات الألوان المتعددة من أي من هذه المجموعات السكانية لأن السكان لديهم حمض نووي مماثل في ذلك الجينوم منطقة.

كيف تعرف ما إذا كان والديك مرتبطين

قسم "هل والداك مرتبطان؟" ترى أداة GEDmatch ما إذا كان والداك قرابة من خلال مقارنة الحمض النووي الخاص بك مع نفسه.
قسم “هل والداك مرتبطان؟” ترى أداة GEDmatch ما إذا كان والداك قرابة من خلال مقارنة الحمض النووي الخاص بك مع نفسه.

على غرار الطريقة التي تتيح لك GEDmatch العثور على أقارب في قاعدة بيانات الحمض النووي الخاصة بهم عن طريق مطابقة أجزاء من الحمض النووي الخاص بك مع الحمض النووي الخاص بهم ، يمكنك التحقق مما إذا كان والداك مرتبطين من خلال البحث عن أجزاء من الحمض النووي الخاص بك تطابق نفسه. لديك نسختان من كل كروموسوم ، واحدة من كل والد. ويمكن مقارنتها ببعضها البعض. إذا كانت القطع الكبيرة متطابقة ، فمن المحتمل أن والديك يشتركان في سلف مشترك حديث.

لحسن الحظ ، كانت نتائجي مملة جدًا.

لا يرتبط والداي ببعض القرابة ، كما يتضح من القطع الصغيرة من تعدد الأشكال الأخضر المطابق في GEDmatch.
لا يرتبط والداي ببعض القرابة ، كما يتضح من القطع الصغيرة من تعدد الأشكال الأخضر المطابق في GEDmatch.

يشير اللون الأحمر إلى عدم وجود تطابق ، بينما يشير اللون الأخضر إلى وجود تطابق ، بينما يشير اللون الأزرق إلى وجود تطابق طويل. من المتوقع أن تحدث بعض المباريات القصيرة بالصدفة. تشير العديد من المطابقات الطويلة إلى أن والديك مرتبطان.

كيف تتحقق مما إذا كنت مرتبطًا بأي إنسان قديم

يمكن إجراء مطابقات الحمض النووي من واحد إلى عدة على عينات بشرية قديمة باستخدام "تطابق الحمض النووي القديم".
يمكن إجراء مطابقات الحمض النووي من واحد إلى عدة على عينات بشرية قديمة باستخدام “تطابق الحمض النووي القديم”.

كل شخص ينحدر من بعض البشر القدامى ، ولكن لم يتم تسلسل كل البشر القدامى. من حين لآخر ، يجد العلماء بقايا قديمة لا تزال تحتوي على الحمض النووي البشري في حالة جيدة بما يكفي لاستخراج المعلومات الجينية.

يعمل هذا التطبيق بطريقة مشابهة لأداة مقارنة الحمض النووي من شخص إلى كثير والتي من المحتمل أنك ما زلت تنتظر تشغيلها. يقارن الحمض النووي الخاص بك بالعينات القديمة ويتحقق من تطابق أي امتدادات طويلة.

تتيح لك الأداة تغيير مدة امتداد المطابقة. 0.5 سم قصير جدًا وهناك الكثير من التطابقات. العديد من التطابقات لا تشير بالضرورة إلى وجود علاقة وثيقة. يتم الإشارة إلى هذه باللون البرتقالي. يُظهر كل شريط برتقالي أي جزء من كروموسومات الإنسان القديم يطابق لي.

تمثل القضبان البرتقالية تطابقًا لا يقل عن 0.5 سم بيني وبين هؤلاء البشر القدامى.
تمثل القضبان البرتقالية تطابقًا لا يقل عن 0.5 سم بيني وبين هؤلاء البشر القدامى.

ومع ذلك ، إذا قمت بزيادة الامتداد الذي يجب أن يتطابق مع رقم أكبر ، هنا 5 سم ، فإن امتدادات أقل تتطابق بشكل ملحوظ. هذا يعني أنني لست وثيق الصلة بهؤلاء البشر القدامى. لم تكن هناك مباريات فوق 6 سم.

يمثل كل شريط الآن 5 سم وهناك عدد أقل بكثير.
يمثل كل شريط الآن 5 سم.

كيف تنظر إلى شرائح مطابقة في عدة أشخاص

يتيح متصفح GEDmatch 3-D Chromosome للمستخدمين مقارنة كروموسوم واحد بين عدة أشخاص.
يتيح متصفح GEDmatch 3-D Chromosome للمستخدمين مقارنة كروموسوم واحد بين عدة أشخاص.

بدلاً من مقارنة الكروموسومات الخاصة بك مع الكروموسومات الأخرى فقط (واحد لأكثر) ، يتيح متصفح الكروموسوم ثلاثي الأبعاد إجراء ما يصل إلى 9 مقارنات في وقت واحد (متعدد إلى متعدد).

يُظهر كل شريط الأجزاء المطابقة من الكروموسومات بين شخصين.
يُظهر كل شريط الأجزاء المطابقة من الكروموسومات بين شخصين.

أنا هنا أنظر إلى فردين من الوالدين والطفل وأحد أفراد الأسرة ذوي القرابة البعيدة. الأشرطة الملونة هي أجزاء من الكروموسوم X تتطابق بين الشخصين. يظهر اللون البرتقالي أن معظم كروموسوم X يتطابق بين الأم والطفل.

الجزء المركزي الذي لم يتم تمييزه كمطابقة هو السنترومير. يوجد مركز مركزي في منتصف كل كروموسوم. الحمض النووي المركزي متكرر جدًا ولا يحتوي على أي جينات. لذلك لا يتم تضمينه عادة في تحليل SNP.

من المحتمل أيضًا أن يكون لدى الأم والطفل نقاط مركزية متطابقة ، ولكن نظرًا لعدم تحليل تعدد الأشكال في تلك المنطقة ، فلا يمكن تأكيد أنهما متماثلان.

تُظهر الأشرطة الصفراء جزءًا من كروموسوم X الذي يتطابق مع أفراد الأسرة الأكثر ارتباطًا. هذه القطعة أصغر لأن الفرد أكثر ارتباطًا. تتطابق القطعة أيضًا مع كل من الأم والطفل ، مما يشير إلى أن القريب يرتبط بالطفل من خلال الأم. إذا كان القريب البعيد مرتبطًا بالطفل من خلال الأب ، فلن يكون هناك تطابق.

يمكنك استخدام متصفح الكروموسوم ثلاثي الأبعاد لأي فرد لديك عدد مجموعات منهم. ومع ذلك ، فإن الأفراد غير المرتبطين لن يكون لديهم الحمض النووي المطابق ولن يقدموا مؤامرات مثيرة للاهتمام للغاية.

كيف تجد أرقام المعدات للأفراد ذوي الصلة؟ أنت تستخدم أداة رأس بأطراف!

كيفية استخدام أداة رأس بأطراف

مثال على ما يتم عرضه باستخدام أداة GEDmatch الفردية.
مثال على ما يتم عرضه باستخدام أداة GEDmatch الفردية.

بعد يوم إلى يومين من تحميل معلومات الحمض النووي الخاصة بك ، يمكنك كتابة رقم مجموعة (أو أي شخص) في الأعلى والضغط على بحث. سيؤدي هذا إلى سحب الأفراد الذين يشاركونك أجزاء من الحمض النووي ، والمعروفين أيضًا باسم عائلتك.

العمود الأول هو رقم المجموعة ، والذي يحدد بشكل فريد تحميل الحمض النووي ويسمح لأي مستخدم بتكرار أي تحليل باستخدام رقم المجموعة هذا بدلاً من رقمه الخاص. هذا يعني أنه يمكنك أخذ رقم المجموعة الذي تجده هنا وتوصيله بالأدوات الموضحة أعلاه: يمكنك معرفة مزيجهم / تراثهم ، إذا كان والديهم مرتبطين ، أو مقارنة كروموسوماتهم بأي شخص آخر تقوم بنسخه ولصقه.

العمود الثاني هو أي اسم مستعار يختار المستخدم استخدامه لتلك المجموعة والثالث هو البريد الإلكتروني للمستخدم. قد لا يكون المستخدم هو الشخص الذي ينتمي إليه الحمض النووي. لا يجب أن تفترض أن هذا البريد الإلكتروني يخص قريبك ، فقط أنه ينتمي إلى شخص لديه تفويض بتحميل معلومات الحمض النووي الخاصة بأقاربك.

بعد معلومات المستخدم “GED”. يرمز GED في GEDmatch GE نيالوجي د آتا. يأتي هذا من GEDCOM ( GE نيالوجي د آتا COM اتصالات) تنسيق الملف.

إذا كان لديك شجرة عائلة مفصلة في برنامج أبحاث الأنساب ، فيمكن تصديرها بتنسيق GEDCOM وتحميلها إلى GEDmatch. سيسمح لك ذلك بربط أشجار العائلة باستخدام ميزة الارتباط في أداة GEDmatch’s one-to-many. إذا كانت هناك مجموعة تحتوي على إدخال GEDCOM مرتبط بها ، فستظهر كارتباط في هذا العمود.

يشير العمر بالأيام إلى المدة التي مرت منذ تحميل المجموعة. النوع يصف. الجنس هو ثنائي ذكر أو أنثى أشار إليه المستخدم عند تحميل المجموعة. الإدخالات الأخرى التي يمكن أن يشير إليها المستخدم هي مجموعات هابلوغروبس: Mt و Y.

Mt هو اختصار للميتوكوندريا. تنتقل الميتوكوندريا من الأم إلى الطفل ولا تتحد أو تتشظ مع كل جيل ، كما يفعل معظم الجينوم. يسمح للناس بتتبع نسبهم مباشرة من خلال أمهاتهم.

Y مشابه لجبل ولكن للذكور فقط. فقط نهايات الكروموسوم Y هي القادرة على إعادة الاتحاد مع كروموسوم X ، مما يعني أن معظم كروموسوم Y ينتقل من الأب إلى الابن. وهذا يسمح للرجال بتتبع نسبهم من خلال آبائهم.

لن يخبرك GEDmatch بمجموعة هابلوغروب الخاصة بك ، ولكن قد تتمكن من معرفة ما إذا كان أقاربك لديهم معلومات هابلوغروب الخاصة بهم. إذا كنت تشترك في سلف أم مشترك ، فلديك نفس مجموعة هابلوغ من جبل إم. إذا كنت ذكرًا وتشترك في سلف مشترك من الأب كذكر آخر ، فلديك نفس مجموعة هابلوغروب Y.

التالي هو “إجمالي سم” المباراة. CentiMorgans هي مقياس لطول الحمض النووي الذي يؤثر على عدد مرات إعادة توحيد بعض البقع. بعد ذلك يوجد عمودين هما “أكبر” والذي يشير إلى أطول جزء يتطابق بين فردين.

يعطي عمود “الأجيال” تقديرًا لعدد الأجيال التي تفصل بين شخصين. يمثل الرقم 1 العلاقة بين الوالدين والطفل ، و 1.2 يمثل الأخ ، و 1.4 يمثل نصف الأخ أو العم أو الجد. 2 سيكون ابن عم لأن آخر سلف مشترك كان قبل جيلين ، 2.6 سيكون ابن العم الأول بمجرد إزالته ، 3 سيكون ابن العم الثاني مع آخر سلف مشترك منذ 3 أجيال. التنبؤ ينهار على 4.

الفرد المثال لديه اثنين من الأقارب من الدرجة الأولى ، إما الوالدين أو الأطفال ، أحد الأقارب بدرجة 1.5 ، مثل العمة ، وأحد الأقارب من الدرجة الثانية ، من المحتمل أن يكون ابن العم. كانت جميع نتائجي الخاصة تتجاوز أقارب الدرجة الرابعة.

يوضح المصدر الشركة التي تم إنشاء البيانات الجينومية بواسطتها أو أنه تم ترحيل (نقل) البيانات من موقع GEDmatch القديم. تعد القدرة على السحب من مجموعات اختبار الحمض النووي المختلفة إحدى الفوائد الأصلية لـ GEDmatch. إذا أراد المستخدم البحث عن أفراد العائلة ، فلن يضطر إلى شراء كل من مجموعات Ancestry و 23andMe. يمكن للمستخدم البحث في جميع بيانات الحمض النووي التي تم تحميلها بغض النظر عن خدمة اختبار الحمض النووي.

يصف عمود “التداخل” عدد أشكال النيوكلوتايد التي تمت مقارنتها بالفعل. لا يتم تنفيذ ذلك للمجموعات التي تم ترحيلها. لا يحتاج نظام التكوين الجديد إلى أن تختبر المجموعات نفس تعدد الأشكال بالضبط من أجل القول إن فردين مرتبطان. ومع ذلك ، فإن المزيد من SNPs المطابقة مباشرة يعني المزيد من اليقين في المباراة.

كيفية التكرار مع GEDmatch

الكثير من المرح في GEDmatch هو القدرة على النظر إلى الروابط بين الناس. إذا قام عدد كافٍ من أقاربك بتحميل بياناتهم ، فيمكنك العثور عليها ، ومعرفة أي منها مرتبط ببعضها البعض ، وبناء شجرة عائلتك. بمجرد العثور على عدد مجموعات الأشخاص المرتبطين بك ، يمكنك إجراء أي تحليل على هذا الشخص كنت ستفعله على نفسك. يمكن أن يسمح لك ذلك بتحديد مصدر الأجزاء المختلفة من تراثك.

حتى إذا لم يكن لديك أي أقارب ، يمكنك العثور على مجموعات من الغرباء والعثور على روابط عائلية والتعرف على تاريخ عائلاتهم وتراثهم. يمكن أن يكون هذا ممتعًا بطريقة فضولية ، ولكن تذكر ، يمكن لأي شخص آخر فعل الشيء نفسه مع بياناتك.

كيف تحذف بياناتك من GEDmatch

لإزالة بياناتك من GEDmatch ، انقر فوق القلم الرصاص بجوار معلومات المجموعة في الصفحة الرئيسية.

يمكن تحرير إعدادات ملف تعريف GEDmatch DNA باستخدام زر القلم الرصاص.
يمكن تحرير إعدادات ملف التعريف الجيني GEDmatch باستخدام زر القلم الرصاص.

سيتم نقلك إلى صفحة “إدارة ملف تعريف Kit”. تتيح لك هذه الصفحة تحديث أي من المعلومات المقدمة لمجموعة أدواتك.

تقرأ علامة التبويب الثانية “Kit Removal”. إذا قمت بالنقر فوقها سيتم نقلك إلى الصفحة الموضحة أدناه. أدخل كلمة المرور الخاصة بك وانقر فوق حذف.

 كلمة مرور الحساب مطلوبة لإزالة معلومات الحمض النووي من GEDmatch.
كلمة مرور الحساب مطلوبة لإزالة معلومات الحمض النووي من GEDmatch.

الأسئلة الشائعة حول GEDmatch

ما هو GEDmatch؟ ماذا تفعل GEDmatch؟

GEDmatch هو موقع علم الأنساب الجيني يتيح للمستخدمين تحميل ملفات تعريف الحمض النووي الخاصة بهم من شركات أخرى والعثور على الأقارب.

كيف تستخدم GEDmatch؟

ينشئ المستخدم ملفًا شخصيًا ويحمل بيانات الحمض النووي الخاصة به بتنسيق “23andMe”. تستغرق أداة GEDmatch Genesis الخاصة بـ GEDmatch Genesis ما يصل إلى يومين للتشغيل ، ولكن بعد ذلك يمكن للمستخدمين معرفة أي من 1.3 مليون فرد في قاعدة البيانات أكثر ارتباطًا بهم.

هل GEDmatch آمن؟

GEDmatch مملوكة حاليًا لشركة Verogen ، وهي شركة متخصصة في علم الجينوم الجنائي. يمكن للمستخدمين إلغاء الاشتراك في فحص بياناتهم لأغراض إنفاذ القانون ، ولكن لا يزال من الممكن تسليم البيانات إذا تم استدعاءهم.

كيف يتم الرفع إلى GEDmatch؟

لدى GEDmatch بوابة تسمح للمستخدم بتحميل البيانات بتنسيق “23andMe” ، وهو تنسيق قياسي للعديد من SNP المستند إلى شركات اختبار الحمض النووي للمستهلكين.

كيفية استخدام خليط GEDmatch؟

يمكن إجراء تحليل الخلط عن طريق إدخال رقم المجموعة ، واختيار المشروع المناسب لمقارنة الحمض النووي ، واختيار نوع التصور.

ما هو موقف GEDmatch؟

يرمز GED في GEDmatch GE نيالوجي د آتا. يأتي هذا من GEDCOM ( GE نيالوجي د آتا COM اتصالات) تنسيق الملف.

من يملك GEDmatch؟

GEDmatch مملوكة لشركة Verogen ، وهي شركة تساعد مختبرات الطب الشرعي على استخدام تسلسل الجيل التالي.

كيف تجد هابلوغروب على جي إي دي ماتش؟

لن يخبرك GEDmatch بمجموعة هابلوغروب الخاصة بك ولكن قد تتمكن من العثور على قريب من الأمهات مع مجموعة هابلوغروب موثقة من MT أو قريب من الأب مع مجموعة هابلوغروب Y موثقة.

ما هو جينيسيس GEDmatch؟

GEDmatch Genesis هي أداة تسمح بمقارنة ملفات تعريف الحمض النووي للمستخدم حتى لو تم إجراء اختبار الحمض النووي من قبل شركات مختلفة. لا يتطلب اختبار SNPs نفسه للعثور على التطابقات.

هل GEDmatch دقيق؟

تسمح أداة الخلط / التراث من GEDmatch للمستخدم باختيار المشروع الذي يريد مقارنة حمضه النووي به. ستؤدي المشاريع المختلفة إلى نتائج مختلفة للأصول.

هل GEDmatch مجاني؟

العديد من ميزات GEDmatch مجانية ، بما في ذلك أداة المطابقة الأساسية من GEDmatch Genesis ‘واحد لكثير. الميزات الإضافية هي 10 دولارات شهريًا.

ما هو WHG على GEDmatch؟

WHG تعني دبليو الأوروبي الشرقي ح أونتر -G atherer ، وهي إحدى عينات الحمض النووي القديم في puntDNAL والتي يمكن للمستخدمين مقارنة أسلافهم بها.

هل أعجبك هذا البرنامج التعليمي؟ قد تجد هذه الدروس مفيدة أيضًا:

عن الكاتب