La nouvelle maladie à coronavirus (COVID-19)
Au cours des derniers mois, le nouveau coronavirus (SRAS-CoV-2 qui cause la maladie COVID-19), qui est apparu en décembre 2019 à Wuhan, en Chine, a fait la une des journaux en tant que menace pour la santé publique en évolution rapide. À ce jour, plus de 95000 cas et 3200 décès ont été signalé dans 85 pays et territoires. De plus, en raison de la croissance de des médias sociaux plateformes, informations sur COVID-19, y compris restrictions de voyage et impacts économiques , se propage rapidement, peut-être même plus vite que le virus lui-même.
Mais comment un virus, qui est même pas vivant , épave tant de ravages?
Une introduction sur les virus
Virus sont des organismes microscopiques composés de protéines, de graisses, de sucres et de matériel génétique qui existent presque partout sur la planète. Cependant, à eux seuls, les virus ne peuvent rien faire. Pour survivre, les virus doivent infecter les cellules vivantes des hôtes, telles que les bactéries, les champignons, les plantes ou les animaux. Le matériel génétique viral – ADN ou ARN – contient des informations sur la façon dont le virus peut se répliquer ou se reproduire. Une fois qu’un virus infecte une cellule vivante, il détourne la machinerie de la cellule pour créer une «usine de virus».
Virus de l’immunodéficience humaine (VIH)
En 1984, des scientifiques de l’Institut Pasteur de Paris l’Institut National du Cancer ont annoncé la découverte du VIH , un virus qui infecte le système immunitaire humain et peut entraîner le syndrome d’immunodéficience acquise (SIDA). Le SIDA interfère avec la capacité du corps à combattre les infections et les maladies. Le VIH est transmis par les fluides corporels et s’est souvent propagé par des rapports sexuels non protégés, le partage d’aiguilles et par la naissance. Les chercheurs soupçonnent que le VIH est passé des chimpanzés aux humains. Cela était probablement dû à la boucherie et à la consommation de viande de singe au début des années 1900.
Malheureusement, les personnes vivant avec le VIH ont été confrontées à un nombre considérable de discrimination . Par exemple, dès le début, le sida a été mal qualifié de «peste des gays», ce qui suggère qu’il se propage exclusivement parmi les hommes ayant des relations sexuelles avec d’autres hommes. Cependant, des icônes américaines comme la légende du basket Magic Johnson et la rockstar Freddie Mercury, qui ont tous deux annoncé être séropositifs dans les années 1980 et 1990, nous rappellent que les virus ne font pas de discrimination. Presque tout le monde peut être infecté.
Fait intéressant, dans le cas du VIH, certaines personnes résistant ou immunisé contre infection. Ces individus hébergent des mutations génétiques dans le gène CCR5 qui empêchent leurs cellules immunitaires d’afficher un récepteur qui permet au VIH d’entrer dans les cellules et de créer des «usines à VIH».
Coronavirus
Selon l’Organisation mondiale de la santé, les coronavirus constituent une grande famille de virus nommés pour les pointes en forme de couronne trouvées sur leurs surfaces (Figure 1). Ils transportent leur matériel génétique dans des brins simples d’ARN et provoquent des problèmes respiratoires et de la fièvre. Comme le VIH, les coronavirus peuvent être transmis entre les animaux et les humains. Les coronavirus sont responsables de la pandémie du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) au début des années 2000 et de l’épidémie du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS) en Corée du Sud en 2015. Alors que le coronavirus le plus récent, le SRAS-CoV-2, a suscité des inquiétudes internationales, séquençage accessible et peu coûteux nous aide à comprendre la maladie qu’il cause, le COVID-19, et à réagir rapidement à l’épidémie.
Figure 1. Coronavirus avec les pointes caractéristiques vues au microscope.
Les premières études qui explorent la susceptibilité génétique au COVID-19 sont en cours de publication . Les premiers résultats indiquent que le SRAS-CoV-2 infecte les cellules en utilisant le récepteur de surface cellulaire ACE2. Les variantes génétiques du gène du récepteur ACE2 sont donc susceptibles d’influencer l’efficacité avec laquelle le SRAS-CoV-2 peut pénétrer dans les cellules de notre corps. Les chercheurs espèrent découvrir des variantes génétiques qui confèrent une résistance à une infection par le SRAS-CoV-2, similaire à la façon dont certaines variantes du CCR5 gène récepteur immuniser les gens contre le VIH. Chez Nebula Genomics, nous surveillons les dernières recherches sur le COVID-19 et ajouterons toutes les découvertes pertinentes à la Bibliothèque de recherche sur la nébuleuse en temps opportun.
Le rôle de la génomique dans la réponse au COVID-19
Scientifiques en La Chine a séquencé le génome du SRAS-CoV-2 quelques semaines seulement après que le premier cas ait été signalé à Wuhan. Cela contraste avec le SRAS, qui a été découvert à la fin de 2002 mais n’a été séquencé qu’en avril 2003. C’est grâce au séquençage du génome peu coûteux que de nombreux scientifiques du monde entier apprennent et partagent des informations sur le COVID-19, ce qui nous permet de suivre l’évolution du virus en temps réel . En fin de compte, le séquençage peut aider à éliminer la peur de l’inconnu et permettre aux scientifiques et aux professionnels de la santé de se préparer à lutter contre la propagation du COVID-19.
La technologie de séquençage de l’ADN de nouvelle génération nous a permis de comprendre que le SARS-CoV-2 a une longueur d’environ 30 000 bases. De plus, des chercheurs chinois ont déterminé que le SRAS-CoV-2 est également presque identique à un coronavirus trouvé chez les chauves-souris et est très similaire au SRAS. Ces informations ont été essentielles pour aider au développement de diagnostics et de vaccins. Par exemple, les Centers for Disease Control and Prevention ont élaboré un test de diagnostic pour détecter l’ARN du SRAS-CoV-2 à partir de prélèvements nasaux ou buccaux.
De plus, un certain nombre d’agences gouvernementales et de sociétés pharmaceutiques sont en train de développement de vaccins COVID-19 pour empêcher le virus d’infecter plus de personnes. Pour protéger les humains de l’infection, des particules virales inactivées ou des parties du virus (par exemple des protéines virales) peuvent être injectées à des humains. Le système immunitaire reconnaîtra le virus inactivé comme étranger, amorçant le corps à construire une immunité contre une éventuelle infection future. À noter, Moderna , la Institut national des allergies et des maladies infectieuses , et le Coalition for Epidemic Preparedness Innovations a identifié un candidat vaccin COVID-19 dans un dossier 42 jours . Ce vaccin sera testé dans des essais cliniques humains à partir d’avril.
Pour plus d’informations sur COVID-19, veuillez vous référer à l’Organisation mondiale de la santé site Internet . Vous pouvez également trouver Statistiques récapitulatives du COVID-19 GWAS ici .
Vous pouvez également en savoir plus sur les tests de coronavirus dans cet article de blog.
