YFull Review – Was können Sie von Ihrem Y-Chromosom lernen?

yfull-Bewertung

Zusammenfassung der vollständigen Überprüfung

YFull ist eine Upload-Site für Y-Chromosomen- und mitochondriale DNA-Sequenzierungsdaten, die eine gründliche Analyse der Vorfahren ermöglicht. Erfahren Sie mehr in unserem YFull-Test!

Nebula Genomics

Ergebnisse
Preis
Umfassend

Zusammenfassung

YFull analysiert Y-Chromosom und mtDNA zu einem angemessenen Preis, obwohl die Informationen auf diese Abschnitte des Genoms beschränkt sind.

4.3

Herausgegeben von Christina Swords, Ph.D.

7 Fakten aus unserem YFull Review

  1. YVoller Standort: Moskau, Russland
  2. Dienstleistungen: Hochladen von DNA-Daten und Interpretation von Y-DNA und mtDNA
  3. So funktioniert es: Laden Sie DNA-Rohdaten von anderen Unternehmen als BAM- oder VCF-Datei hoch, um Berichte zu erhalten
  4. Berichte: Y-DNA- und mtDNA-Interpretation
  5. Privatsphäre: aktiver Austausch aggregierter Kundendaten mit Dritten
  6. Kosten: 49 USD für die Y-DNA-Analyse, weitere 25 USD für die mtDNA-Analyse
  7. Ergänzende Dienstleistungen: Nebula Genomics (die günstigste 30-fache Sequenzierung des gesamten Genoms, einschließlich Y-DNA und mtDNA)

YVolle Einführung

Dies ist eine Überprüfung von YFull, einer Upload-Site für Y-Chromosomen- und mitochondriale DNA-Sequenzierungsdaten, die erweiterte Ahnenanalysen bietet.

Einzelnukleotidpolymorphismen oder SNPs sind Unterschiede in den DNA-Sequenzen auf der Ebene einzelner Basenpaare. Wenn sich beispielsweise DNA-Sequenzen von zwei Individuen an einer einzelnen Position oder Base unterscheiden, wird dies als SNP bezeichnet.

Andererseits sind kurze Tandem-Wiederholungen oder STRs eine Reihe von wiederholten DNA-Sequenzen (A, T, C oder Gs), die sich zwischen Individuen unterscheiden. Das Identifizieren der Anzahl von Wiederholungen in bestimmten Bereichen des Genoms kann einen „DNA-Fingerabdruck“ erzeugen. Dieser genomische Fingerabdruck kann sowohl von professionellen als auch von Amateur-Genealogen verwendet werden, um die genetische Genealogie eines Individuums zu untersuchen.

SNPs und STRs sind zusammen Marker, die vererbt werden können. Die Kombination solcher Marker ist als Haplotyp bekannt. Es gibt verschiedene Y-DNA- und mt-DNA-Tests für verschiedene Haplotypen, die Individuen einer bestimmten „Haplogruppe“ zuordnen können. Während Y-DNA-Tests mehr über die väterliche Herkunft aussagen können, berichten mtDNA-Tests über die mütterliche Herkunft.

YFull wurde 2013 in Moskau, Russland, mit dem spezifischen Zweck gegründet Dolmetschen Y-Chromosomensequenzen. In diesem Sinne ist der Dienst kein DNA-Testunternehmen. Vielmehr handelt es sich um ein Analyseunternehmen, das Sequenzierungsinterpretationen der nächsten Generation (für Y-DNA und mtDNA) anbietet. Darüber hinaus bietet das Unternehmen eine bequeme Visualisierung der DNA-Ergebnisse und einen detaillierten, öffentlichen Haplogruppen-Yfull-Baum, sodass Sie Ihren „Pfad der Mutationen“ mit dem „Pfad der Mutationen“ anderer Proben in der YFull-Datenbank vergleichen können.

Das ursprüngliche Team bestand aus Vadim Urasin, der seit 2008 ein aktiver Teilnehmer der DNA-Genealogie ist. Weitere Mitglieder des ursprünglichen Teams sind Vladimir Tagankin, der Entwickler der DNA-Datenbank “semargl.me”, und Roman Sychev, Moderator auf dna-forums.org.

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So laden Sie Ihre Daten auf YFull hoch

Beginnen wir die YFull-Überprüfung mit einem Überblick über den Service.

Ein Diagramm, in dem detailliert angegeben ist, welche Funktionen in der NGS-Interpretation für VCF- und BAM-Dateien angegeben sind.
Ein Diagramm, in dem detailliert angegeben ist, welche Funktionen in der NGS-Interpretation für VCF- und BAM-Dateien angegeben sind.

Zu Auftrag Bei einer YFull-Testanalyse müssen Rohdaten von anderen Gentest-Anbietern auf YFull.com hochgeladen werden. Ihre Rohdatendatei kann von Nebula Genomics, FTDNA Big Y, Full Genomes Inc., YSEQ, Enlighten, Veritas Genetics, BGI, Novogene, 23mofang, Dante Labs, WeGene oder Yoogene stammen. Sie können Kit-Nummern mit Bezug auf YFull-IDs vergleichen, um den Zugriff zu erleichtern. Die Daten können als BAM-Datei oder VCF-Datei hochgeladen werden. Eine Einschränkung ist, dass die Datenextraktion aus VCF-Dateien unvollständig ist (etwa 50-70% der Daten). Außerdem werden STR-Übereinstimmungen nicht gemeldet, wenn eine VCF-Datei hochgeladen wird. Schließlich akzeptiert YFull keine Daten im FASTQ-Format. Für optimale Ergebnisse muss daher eine BAM-Datei hochgeladen werden. Mithilfe von Diensten wie Dropbox oder Google Drive muss ein URL-Link zu Ihrer Rohdatendatei bereitgestellt werden.

Schließlich können Kunden bei der Bestellung einen Benutzernamen erstellen. Zum Zeitpunkt der Bestellung ist keine Zahlung erforderlich.

YVolle Bestellseite.
YVolle Bestellseite.

Nach einigen Wochen sind die Ergebnisse fertig. Derzeit wird eine Zahlung von 49 USD über Paypal, Apple Pay, Cloud Payments oder Kreditkarte angefordert. Gegen Aufpreis (25 USD) kann man auch eine mtDNA-Interpretation erhalten.

Ein Diagramm, in dem detailliert angegeben ist, welche Merkmale in der NGS-Interpretation für mtDNA angegeben sind.
Ein Diagramm, in dem detailliert angegeben ist, welche Merkmale in der NGS-Interpretation für mtDNA angegeben sind.

Überprüfung der YFull-Berichterstattung

Wie bereits erwähnt, gibt es zwei Arten von Y-DNA-Mutationen: SNPs und STRs. Beide Arten von Mutationen sind aus verschiedenen Gründen nützlich, um sie zu untersuchen. YFull bietet eine Analyse sowohl von SNPs als auch von STRs.

YFull Kundenhomepage.
YFull Kundenhomepage.

Laut YFull sind 185.780 SNPs und über 780 STRs bekannt. Es gibt 1.482.319 neuartige Varianten, die zuvor noch nicht entdeckt wurden.

Liste bekannter SNPs.
Liste bekannter SNPs.

Der bekannte SNP-Bericht zeigt die Position des Kunden auf dem Y-Haplotree und die SNP-Ergebnisse für alle SNPs, die im Zweig des Kundenbaums getestet wurden. Zusätzliche Listen von SNPs werden auf benachbarten Registerkarten bereitgestellt, wobei „mehrdeutige“ SNPs und keine Anruf-SNPs hervorgehoben werden (dh SNPs, die während des Prozesses der Genotypisierung der DNA einer Person nicht bestimmt wurden).

YVolle Liste neuartiger SNPs.
YVolle Liste neuartiger SNPs.

Eine Liste neuartiger oder privater SNPs kann ebenfalls angezeigt werden. Diese neuartigen SNPs sind nach Qualität geschichtet (z. B. Best, Acceptable, Ambiguous, Low, One Reading). Alle privaten SNPs haben ein YFS-Präfix. Das rote Häkchen neben einigen dieser SNPs bedeutet, dass sie über YSEQ überprüft werden können. Das G bezieht sich auf das Gen, in dem sich dieses SNP befindet.

Ausgerichtete Sequenzierungslesungen.
Ausgerichtete Sequenzierungslesungen.
Liste der Indels.
Liste der Indels.

Der Bericht zeigt auch Insertionen und Deletionen (Indels), die Positionen in der Sequenz sind, die zusätzliche Nukleotide aufweisen.

YFull enge Übereinstimmungen.
YFull enge DNA-Übereinstimmungen.

Darüber hinaus kann auf SNP-Übereinstimmungen zugegriffen werden, bei denen es sich um SNPs handelt, die gemeinsam genutzt werden oder von denen angenommen wird, dass sie mit anderen Stichproben in der YFull-Datenbank geteilt werden, und die auf einen entfernten gemeinsamen Vorfahren zurückgeführt werden können. Das Beispiel eines Kunden wird weiterhin verglichen, wenn die Datenbank aktualisiert wird. Wenn später festgestellt wird, dass einer dieser privaten SNPs mit neu entdeckten YFull-Beispielen übereinstimmt, erhalten diese SNPs Namen in der Y-Serie .

YVolle Suche in einer BAM-Datei.
YVolle Suche in einer BAM-Datei.

Man kann auch einzelne SNPs beobachten, um mehr Informationen zu erhalten, einschließlich der Anzahl der Lesevorgänge, die diesen SNP überlappen, Referenzsequenzen usw.

YFull SNP-Abfragefunktion.
YFull SNP-Abfragefunktion.

Es gibt eine nützliche Funktion, mit der Kunden Ergebnisse nach SNP-Namen abfragen können.

Wir beenden unsere Überprüfung der YFull-Berichterstattung mit einem Blick auf die YReport-Funktion. YTree umfasst Stammbaum-DNA-Haplogruppen und SNPs, die in jeder Haplogruppe gemeinsam genutzt werden (Y-SNPs). YTree basiert auf öffentlichen Beispieldaten, einschließlich der 1000-Genom-Projekt . YTree wird fast jeden Monat aktualisiert, basierend auf Beiträgen von Haplogruppen-Experten, ISOGG und anderen. Die Liste der SNPs von der Wurzel bis zur terminalen Haplogruppe kann gemeinsam genutzt werden.

YFull YTree.
YFull YTree.
YTree-Statistiken.
YTree-Statistiken.

Man kann auch STR-Ergebnisse (780, die getestet werden), Übereinstimmungen und Varianten im üblichen Format 12, 25, 37, 67 und 111 beobachten.

Ein Beispiel für YFull-Ergebnisse
YFull STR Marker Ergebnisse.

Weitere Merkmale sind Altersschätzungen für Haplogruppen, die auf einer Studie von 2015 basieren, in der die Autoren eine originelle Methode zur Auswahl echter Mutationen skizzieren. Wenn die Rohdaten eines Kunden eine mtDNA-Sequenzierung enthalten, basieren mtDNA-Haplogruppen auf PhyloTree sind aufgelistet. Im März 2019 führte die Plattform die mtDNA-Analyse gegen eine zusätzliche Gebühr ein.

Weitere Dienstleistungen umfassen:

  • Statistiken wie BAM-Dateigröße, zugeordnete Lesevorgänge, Längenabdeckung, mittlere Tiefenabdeckung und mehr (im YReport)
  • CSV-Dateien (durch Kommas getrennte Dateien) für bekannte SNPs, neuartige SNPs und bekannte STRs
  • Die Fähigkeit, Rohdaten nach Position zu durchsuchen (Genom baut hg19 oder hg38 auf)
  • Meine Neuigkeiten: eine chronologische Auflistung der Änderungen an YTree seit Ihrem YFull-Beispiel (nach Aktualisierungen)

Sie können eine Tour machen dieser Funktionen auf der YFull-Website.

Überprüfung der YFull-Privatsphäre

Die Website ist Datenschutz-Bestimmungen erklärt, dass “YFull.com Ihre Privatsphäre respektiert und Ihre persönlichen Daten nicht ohne Ihre Zustimmung weitergibt”, sofern dies nicht gesetzlich vorgeschrieben ist. Die Richtlinie besagt ferner, dass „aggregierte genetische und selbst gemeldete Informationen“ an Dritte weitergegeben werden dürfen.

Diese Informationen werden von allen identifizierenden Informationen befreit, die einer bestimmten Person zugewiesen werden können. Diese gesammelten Informationen können auch in veröffentlicht werden von Experten begutachtete wissenschaftliche Zeitschriften .

Das Anhang zu persönlichen Informationen In der Datenschutzrichtlinie wird die Vielfalt der gesammelten Benutzerdaten angegeben. Dies umfasst E-Mail-Adresse, Herkunftsinformationen und genetische Gendaten, Cookies und IP-Adresse.

Das YFull-Team hat vollen Zugriff auf diese Daten. Teilweiser Zugriff auf bestimmte Daten kann Mitgliedern von Gruppen gestattet werden, denen der Benutzer beigetreten ist.

Citizen Science und akademische Forscher können diese Daten ebenfalls verwenden. Dies tritt in Fällen auf, in denen der Benutzer die persönliche Erlaubnis zur Teilnahme an einer Studie erteilt hat. YFull speichert Ihre Daten so lange, wie die Website auf einem Server vorhanden ist. Dieser Server befindet sich in einem sicheren Rechenzentrum in Moskau, Russland.

Einige Informationen, z. B. E-Mail-Adressen, werden auf Google-Servern gespeichert. Sie können Ihre Daten und Ihr Konto jederzeit löschen, indem Sie zur Seite “Einstellungen” navigieren. Alle mit Ihrem Konto verknüpften Beispiele werden gelöscht und können nicht wiederhergestellt werden, wenn Sie Ihr Konto löschen.

YFull Bewertungen

Einige kurze Bewertungen finden Sie auf der Unternehmenswebseite . Darüber hinaus haben einige Benutzer Blog-Posts verfasst, in denen ihre Erfahrungen mit den Diensten des Unternehmens beschrieben werden:

YFull hat auch ein Publikum Facebook-Gruppe mit über 3500 Mitgliedern.

Überprüfung der Vor- und Nachteile von YFull

Vorteile

  • Ihr Upload wird Ihnen erst in Rechnung gestellt, wenn Ihre Ergebnisse vorliegen und für die Plattform keine Abonnementgebühren anfallen.
  • Hier finden Sie zusätzliche Informationen zu Ihren privaten Varianten. Dies schließt die verschiedenen Namen ein, die diesen Varianten gegeben wurden, und die Regionen des Y-Chromosoms, in denen diese Varianten auftreten.
  • Sie können die Ergebnisse über verschiedene NGS- oder Gesamtgenomtests hinweg vergleichen, die Sie durchgeführt haben.
  • YFull Groups können alle STRs anzeigen und vergleichen (nicht nur die ersten 111).
  • Sie können SNP-Übereinstimmungen in YFull-Gruppen nicht nur für Ihr Terminal-SNP finden, sondern für jede benannte oder unbenannte Variante.
  • Sie können andere Mitglieder und den Gruppenadministrator in Ihren YFull-Gruppen kontaktieren.
  • Fragwürdige SNPs oder STRs aus Ihrem NGS-Test können bei YSEQ überprüft und zu Ihren Testergebnissen hinzugefügt werden.
  • Die Plattform ist auch so ausgestattet, dass sie die Interpretation der mtDNA-Sequenzierung unterstützt.

Nachteile

  • Die STR-Analyse hat weniger Priorität als die SNP-Analyse und dauert mehrere Wochen, wodurch der Erhalt der Interpretationsergebnisse verzögert wird.
  • YTree wird monatlich aktualisiert, während andere Dienste wöchentlich aktualisiert werden.

Nebula Genomics

Wir beenden unsere YFull-Überprüfung mit einigen ergänzenden Produkten.

Möchten Sie die vollständigsten Y-Chromosomen- und mtDNA-Sequenzierungsdaten für YFull verwenden? Nebula Genomics bietet die günstigsten 30 Whole Genome Sequencing! Darüber hinaus können unsere Daten in FamilyTreeDNA importiert werden, das auch Zugriff auf eine große Datenbank mit Y-Chromosomen- und mitochondrialen DNA-Daten bietet. Lesen Sie mehr im Blog, um mehr über die Bedeutung der Sequenzierung zu erfahren Y-DNA und mtDNA und Vaterschaftstests .

Andere DNA-Upload-Sites, die Sie möglicherweise überprüfen möchten, sind:

  • DNA Land (kostenloser DNA-Upload zur Analyse von Merkmalen und Vorfahren)
  • DNA-Maler (für die Genealogie – die erste ist kostenlos und Abonnements sind für andere verfügbar)
  • GedMatch Genesis (kostenloser DNA-Upload und kostenpflichtige erweiterte Optionen)
  • Genetischer Geist (kostenlos für die Gesundheitsberichterstattung)
  • Lebende DNA (kostenloser Upload für Vorfahren)
  • Mein Erbe (kostenloser Upload für Genealogie)
  • MyTrueAncestry (Lernen Sie Ihre Verbindung zu alten Bevölkerungsgruppen – kostenloser Upload – 397 US-Dollar)
  • WeGene (ein Fokus auf asiatische Bevölkerung, Kosten für Berichte)

Sie können sich auch FamilyTreeDNA ansehen (Big Y-Ergebnisse, die einen STR-Test und einen SNP-Test enthalten).

Hat Ihnen unsere YFull-Bewertung gefallen? Du kannst lesen Weitere Bewertungen auf unserem Blog, einschließlich eines kostenlosen Service namens YSEQ und schauen Sie sich unsere an Komplette Anleitung zum besten DNA-Testkit und anderen Heimtests .