目次
Christina Swords、Ph.D。が編集
YSEQレビューからの7つの事実
- YSEQの場所:ドイツ
- サービス:複数の次世代シーケンシング製品(Y染色体DNAテスト、mtDNAおよび全ゲノムシーケンシング)
- データのダウンロード:生のDNAデータのダウンロードが可能
- レポート:カスタムシーケンス製品、DNA解釈レポートなし
- プライバシー:サンプルは破棄され、データはリクエストに応じて削除されます
- 費用: 100ドル未満から1500ドル以上の範囲
- 代替案:星雲ゲノミクス(最も手頃な30x全ゲノムシーケンス)
YSEQはじめに
これは、主にY染色体配列決定テストとサービスを提供する消費者向け遺伝子検査会社であるYSEQのレビューです。 ThomasとAstridKrahnによって設立されました。 近年では、同社は拡大し、現在はミトコンドリアDNA(mtDNA)および常染色体DNA検査(全ゲノムシーケンス)も提供しています。 YSEQはドイツを拠点とし、Family TreeDNAの元従業員であったThomasKrahnとAstridKrahnによって2013年に設立されました。
YSEQを使用すると、ユーザーは、シーケンスするY染色体またはmtDNAの正確な領域を決定するための完全な権限を持ちます。 同社のキャッチフレーズ「YSEQ:DNA Origins Project」に忠実に、ほとんどのユーザーはこのサービスを使用して祖先をよりよく理解しています。 同社は印象的な範囲のカスタムシーケンスオプションを提供していますが、DNA解釈を含むレポートは提供していません。 ほとんどのユーザーは、次のようなサードパーティのサービスを使用しますYFull 、生データを解釈します。
YSEQはどのように機能しますか?
YSEQサービスのレビュー:SNP、STR、およびハプログループの基礎
一塩基多型、またはSNPは、単一ヌクレオチドレベルでのDNA配列の違いです。 たとえば、2人の個人のDNA配列が一点で異なる場合、それはSNPと呼ばれます。
一方、短いタンデムリピート、またはSTRは、個人間で異なる一連の反復DNA配列です。 ゲノムの特定の領域での繰り返しの数を特定すると、「DNAフィンガープリント」を作成できます。 このゲノムフィンガープリントは、誰かの系図を決定するために使用される場合があります。
一緒に、SNPとSTRは継承できるマーカーです。このようなマーカーの組み合わせは、ハプロタイプ。 さまざまなハプロタイプに対してさまざまなY-DNAおよびmt-DNAテストがあり、特定の「ハプログループ」。 Y-DNA検査は父方の起源についてもっと教えてくれますが、mtDNA検査は母方の起源について教えてくれます。
YSEQが提供するサービスは、Y染色体とミトコンドリアDNAに見られるSTRとSNPのテストに基づいています。 このテストでは、共通の祖先に関連する祖先の起源と遺伝子について人々に詳しく知ることができます。
多数の固定Y染色体ハプログループパネルとSTRマーカーパネルから選択できます。 カスタムハプログループパネルとほぼ無限の数のカスタムSNPもあります。
ユーザーがDNAをYSEQに送信すると、さらに分析が必要になった場合に備えて、会社に保存されます。
YSEQY染色体ハプログループのレビュー
77の厳格なハプログループパネルそして179のカスタムハプログループパネルから選択します。 それぞれが異なる祖先の起源を表しています。
YSEQは、初めてのユーザーがトップレベルのオリエンテーションパネル、159ドルの費用がかかり、すべてのハプログループをカバーします。 このパネルでは、YSEQは複数回のテストを実行して、Y染色体の祖先ツリー内の正確な位置を決定します。
彼らは最初にあなたがM169またはM9カテゴリーに属しているかどうかを決定します。 この情報が利用可能になると、彼らはツリーを下って作業し、スーパークレードを決定します。 各スーパークレードは、異なる祖先の起源に対応しています。 たとえば、ハプログループD-M174は、東アジアとアンダマン諸島で見られます。
他の76の定義されたハプログループパネルはより具体的で、88ドルから99ドルの費用がかかります。 他のテストの以前の結果は、ユーザーが注文したい特定のハプログループパネルを理解するのに役立ちます。
たとえば、 Qスーパークレードパネルこの方向を示す他のSTRテストを持っているユーザー向けです。 このパネルでは、YSEQはマーカーを定義するためにユーザーをテストしてから、祖先ツリーを下っていきます。
YSEQは、77の定義済みハプログループパネルに加えて、他のDNA検査サービスが提供するファミリーファインダーと同様に機能する179のカスタムパネルも提供しています。 これらのパネルは非常に具体的で、より高価です(89ドルから509ドル)。 たとえば、 E1a1-Z31503フェルプスパネル姓の由来「フェルプス」に特に推奨されます。 同様に、 E1b-L1019グッドリッチパネルグッドリッチという姓の人向けです。 YSEQは、そのようなジェノグラフィックプロジェクトに関心のある遺伝子系図学者にとって良い選択肢です。
イギリス諸島に関連するジェノグラフィックプロジェクトに特に興味がある場合は、チェックアウトする必要があります生きているDNA 。
YSEQ Y染色体STR、SNP、およびパネルのレビュー
YSEQは提供しています9つの組み合わせたSTRパネル($ 25- $ 99)、 125の特定のSTR ($ 9.95- $ 15)、および131,611のSNP (各$ 1)から選択します。 利用できないSNPがある場合、ユーザーは特別なリクエストを行うことができます。 各SNPは異なるハプログループに対応しているため、ユーザーはテスト用に独自のカスタムハプログループパネルを作成できます。
ただし、このレベルのカスタマイズ可能なテストには、ある程度の事前知識と調査が必要です。 ユーザーは、特定の家族歴を知り、以前にテストを行い、さらに調査したい正確なハプログループを知る必要があります。
YSEQmtDNAテストのレビュー
YSEQは提供しています4 YSEQmtDNAテスト。 YSEQテストの2つは、ミトコンドリアの超可変領域1(HPV1、$ 25)と領域2(HPV2、$ 25)に対するものです。 ユーザーは、ミトコンドリアDNA全体($ 145)をテストしたり、HPV1またはHPV2から完全なミトコンドリアDNA($ 115)にアップグレードしたりすることもできます。
30の追加もありますmtDNAカスタムパネル、ミトコンドリアDNAの特定の領域に対応します($ 15- $ 60)。
YSEQ全ゲノムシーケンスのレビュー
YSEQは提供しています3つのレベル特に系図研究者のための全ゲノム配列決定の。 YSEQチームはサンプルを受け取ると、DNA濃度を測定し、品質管理を行います。 これが完了すると、NovaSeq6000プラットフォームでのシーケンスのために送信されます。 生のDNAFASTQファイルから、すべてのY染色体SNPに注釈を付け、mtDNAハプログループを提供します。
- 全ゲノムシーケンス45GBases: 579ドル、15倍のカバレッジを提供
- 全ゲノムシーケンス90Gbases: 929ドル、30倍のカバレッジを提供
- 全ゲノムシーケンス150Gbases: 1559ドル、50倍のカバレッジを提供
YSEQは、DNAデータの医学的または健康的な分析を行いません。
YSEQ結果のレビュー
YSEQは、ユーザーDNAサンプルのDNA分析または解釈を行いません。 ユーザーは、報告されたハプログループのテストが陽性か陰性かを確認できます。 ユーザーには、SNPの祖先(ネガティブ)か派生(ポジティブ)かを確認できる表も提供されます。
全ゲノムシーケンスの場合、YSEQは、データで見つかったSNPのリストとその祖先の状態を含む結果ページをユーザーに提供します。
ユーザーは自分のデータをサードパーティのWebサイト( YFull )さらに分析を行いたい場合。
YSEQデータのダウンロード
全ゲノムシーケンスデータは、ダウンロードするか、マイクロSDカードでユーザーに郵送することができます。 YSEQは、Y染色体またはmtDNAデータのダウンロードに関する情報を提供せず、データ形式を指定しません。
YSEQプライバシーのレビュー
ユーザーがDNAをYSEQに送信すると、さらに分析が必要になった場合に備えて、会社に保存されます。 ユーザーは会社に電子メールを送信し、サンプルを破棄することを選択できます。
によるYSEQプライバシーステートメント、彼らは個人情報を非公開に保つためのすべての責任を負います。 しかし、彼らは「許可するのに十分な一般情報を公開しています[them]系図の目的に使用できるDNAデータベースライブラリを構築する」。
ユーザーの同意があれば、このデータは生物学的研究の目的で使用できます。
ニュースのYSEQ
祖先の遺伝学と系図学を専門とするDNA検査会社として、YSEQはニュースで特に取り上げられていません。 イタリアのニュースウェブサイトに掲載されているいくつかの記事は次のとおりです。
- 「「Gli abitanti di Sassalbo? Origini dal Mar Caspio」。 (「サッサルボの住民?カスピ海からの起源」)
- 「「 Dal Medioevo ai giorni nostri:ho ricostruito l’albero genealogico dei Donadoni 」。 (「中世から現在まで:ドナドーニ家系図を再構築しました」)
YSEQレビュー
- cruwysによるYSEQレビュー: YSEQ.net-単一のSNPテストサービスを提供する新会社
- 系統地理学者によるYSEQレビュー:どのテストがあなたの質問に最もよく答えますか?
YSEQの競争力のある新しいWGS価格 - learnalittleeverydayによるYSEQレビュー: STRからSNPへ–私のyDNAテストの最新情報
YSEQの長所と短所
長所 | 短所 |
-カスタマイズの余地がたくさんある、Y染色体DNAテストのための信じられないほどの数のオプション。 –YSEQを使用すると、さまざまなテストを実行して、ユーザーの祖先を簡単に絞り込むことができます。 -全ゲノムシーケンスは、非常に高いカバレッジ(50x)でオプションとして利用できます。 -ユーザーは独自のSNPとSTRをリクエストできます。 | -mtDNAまたは全ゲノムシーケンスのオプションはそれほど広範ではありません。 -同じデータに対してより多くのフォローアップテストが行われるため、コストが増大する可能性があります。 -ユーザーは、データを解釈するために独自の調査を行うか、サードパーティのDNA分析ツールに追加のお金を支払う必要があります。 -非常に高価な全ゲノムシーケンス。 -ウェブサイトをナビゲートするのは難しいです。 |
星雲ゲノミクス
YSEQDNA検査をNebulaGenomicsや他のDNA検査会社と比較することでYSEQレビューを終了します。
Nebula Genomicsは、データの広範な分析を提供することに重点を置いている点で、YSEQや他の遺伝子検査会社とは異なります。 このデータ分析は、染色体の1つまたは2つの領域だけでなく、ゲノム全体に拡張できます。
私たちの目標は、私たちのウェブサイトで最高の体験を提供することです。 ゲノム探索ツールへのフルアクセスにより、隠れた料金やコストを恐れることなく、いつでも遺伝子データを分析できます。 他の企業とは異なり、私たちは最新の研究を使用して毎週あなたの遺伝子レポートを更新します。 さらに、私たちのレポートには、単なる遺伝的祖先以上のものが含まれています。
あなたのためのより少ない努力
祖先であろうと健康であろうと、私たちはあなたのために研究を行います。 結果を理解するために追加の調査を行う必要はありません。 私たちの直感的なインターフェースにより、最小限の労力でDNAデータのロックを解除して理解することができます。
優れたデータには大きな責任が伴います
Nebula Genomicsでは、お客様のプライバシーを何よりも理解し、尊重しています。 データの所有権と管理は、あなたの手に委ねられています。 データを研究者と共有することを選択した場合は、報酬を選択することができます。
データは安全なサーバーに保存され、常に暗号化されます。 あなたはの重要性についてもっと読むことができますDNAプライバシー。
星雲拡張による単なる祖先以上のもの
すでに他社のDNAデータをお持ちですか? DNAデータをアップロードして、星雲ゲノミクス拡張レポート。 私たちのレポートは、マイクロアレイに基づくDNAジェノタイピング法を使用する他の遺伝子会社よりも多くの情報を提供します。 代入と呼ばれる高度な統計モデルを使用して、空白を埋めることができます。
個々の遺伝的特徴について限定的で静的なレポートを作成する代わりに、レポートは毎週更新されます。 の何百もの特性にすぐにアクセスできます星雲研究図書館、隠れた料金なし。
Nebula Genomics 30x全ゲノムシーケンス(NEW!)
私たちの目標は常にあなたの手に力を与えることでした。
他社が使用しているDNA検査法は、部分あなたのゲノムの。 このデータは多くの場合、 1染色体。
これは、貴重な情報を見逃す可能性があることを意味します。 私たち新しい30x全ゲノムシーケンス サービス、私たちはあなたのDNAの100%を読み取ります。 言い換えれば、あなたはあなたのDNAの全体像をレビューします。 10,000倍のデータを提供することができ、これを使用して広範なレポートを提供します。
DNA検査に最適な場所を選ぶことは非常に重要な決定です。 決定を少し簡単にするために、YSEQ、23andMe、AncestryDNA、およびNebulaGenomicsの比較を示します。
YSEQ | 23andMe | AncestryDNA | 星雲ゲノミクス | |
DNA検査法 | Y染色体シーケンシング、mtDNAシーケンシング、全ゲノムシーケンシング(15x-50xカバレッジ) | ジェノタイピング | ジェノタイピング | 全ゲノムシーケンス(30倍のカバレッジ) |
DNAレポート | 提供されていない | 1つの完全なレポート | 1つの完全なレポート | 毎週更新される拡張レポート |
Y-DNA、mtDNA、および祖先レポート | はい。ただし、mtDNAとYDNAを別々に購入する必要があります。 ユーザーは独自の調査を行う必要があります。 | はい | はい | 完全なY染色体とmtDNAシーケンシングによる深い祖先の報告とFTDNA |
データの所有権 | データが誰に属しているのか不明。 | 不明。 お客様は唾液を破壊することができます。 | 不明。 お客様は、DNAおよびデータを削除/破棄できます。 | あなたのデータは永久にあなたのものです |
プライバシーに焦点を当てる | はい | 番号 | 番号 | はい(できます当社のウェブサイトで詳細をご覧ください) |
使用されるセキュリティ技術 | 不明 | SSLなどの標準的なセキュリティプロトコル。 | SSLなどの標準的なセキュリティプロトコル。 | ブロックチェーン、プライバシー保護コンピューティング |
データアップロードオプション | はい、有料です。 | 番号 | 番号 | はい。 代入により、拡張レポートが可能になります |
新しい研究に基づく無料アップデート | 番号。 | 番号。 | 番号。 | レポートには毎週更新があります(もっと詳しく知る) |
データを探索するためのツール | なし。 | 限定 | 限定 | はい (もっと詳しく知る) |
データアクセス | データはダウンロードできますが、形式が不明です。 | はい(23andMe形式のファイル)。 | はい(AncestryDNAフォーマットファイル)。 | はい(FASTQ、BAM、およびVCFファイル)。 |
費用 | 個々のニーズに応じて異なります。 1559ドルまで高くなる可能性があります。 | 99ドル、199ドル、または499ドル。 | 99ドルまたは149ドル。 | $ 0- $ 299 |
シーケンスの重要性について詳しくは、ブログをご覧ください。 Y-DNAとmtDNAそして親子鑑定。
全ゲノムシーケンスに興味がありますか? あなたはこれらの他の製品をチェックすることができます:
- カラーゲノミクス(低カバレッジの全ゲノムシーケンスが利用可能)
- ダンテラボ(30倍の全ゲノムシーケンスで599ドル、ほとんどのレポートは追加料金で利用できます)
- フルゲノム(データのアップロードに75ドル-最も包括的なDNA読み取りに2900ドル)
- 佐野遺伝学(無料アップロード;全ゲノムシーケンス$ 1200)
- Sequencing.com (全ゲノムシーケンスは399ドル)
- ベリタス遺伝学(30倍の全ゲノムシーケンスで599ドル-高度な診断で3599ドル)
- YSEQ (30倍の全ゲノムシーケンスで929ドル)
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