YSEQレビューの概要
概要
YSEQは、複数の次世代シーケンサーを使用してDNAを解析していますが、競合他社に比べて価格が高い傾向があり、また、インターフェースが分かりにくいという問題があります。
YSEQレビューからの7つの事実
- 所在地ドイツ
- サービス内容複数の次世代シーケンサー製品（Y染色体DNA検査、mtDNA、全ゲノムシーケンサー）
- データのダウンロード生DNAデータのダウンロードが可能
- レポートカスタムシーケンス製品、DNA 解析レポートはありません。
- プライバシー機密保持を徹底しているが、本人の許可や緊急の事情がある場合は開示することがある。
- コスト 100ドル未満から1500ドル以上まで幅広い。
- 代替案：星雲ゲノミクス（最も手頃な30x全ゲノムシーケンス）
このレビューは、可能な限り偏りのないものにすることを目的として書かれています。 ただし、これは個々のレビュー担当者の意見を表すため、主観的なものです。 さらに、Nebula Genomicsでは、全ゲノムシーケンスの利点について一般の人々を教育することを目指しています。 したがって、全ゲノムシーケンスDNAテストに関する情報がレビューに組み込まれます。
2022年9月1日
目次
Christina Swords、Ph.D。が編集
長所と短所
長所
- Y染色体DNA検査の選択肢は驚くほど多く、カスタマイズの余地も大きい
- YSEQは、ユーザーの祖先を簡単に絞り込むことができ、そのための様々なテストが用意されています
- オプションとして、非常に高いカバレッジ（50倍）のフルゲノムシーケンスが可能です
- ユーザー自身がSNPsやSTRをリクエストすることが可能
短所
- mtDNAやフルゲノムシーケンスのオプションはそれほど広くはない。
- 同じデータで何度もフォローアップテストを行うため、コストがかさむ可能性がある
- データを解釈するためにユーザー自身が調査するか、サードパーティのDNA解析ツールに追加料金を支払う必要がある
- 非常に高価なフルゲノムシークエンス
- ウェブサイトが見づらい
前書き
YSEQは、主にY染色体シークエンス検査とサービスを提供する消費者直販型の遺伝子検査会社です。
近年では、ミトコンドリアDNA（mtDNA）や常染色体DNAの検査（全ゲノムシークエンス）を行うなど、その範囲を広げています。 これらの技術は、ネイティブアメリカンやアフリカ系などの家系をたどる際にも役立ちます。 ドイツに拠点を置くYSEQは、ファミリーツリーDNAの元社員であるThomasとAstrid Krahnによって2013年に設立されました。
YSEQを使用すると、ユーザーは、シーケンスするY染色体またはmtDNAの正確な領域を決定するための完全な権限を持ちます。 YSEQ: DNA Origins Project」というキャッチフレーズの通り、自分の祖先をより深く理解したいユーザー向けの製品です。
同社はカスタムシーケンスオプションを幅広く提供していますが、このオファーにはDNAの解釈を伴うレポートは含まれていません。 その代わり、ほとんどのユーザーはYFullなどのサードパーティーのサービスを使って生データを解釈する必要があります。
| 30倍速ホールゲノムシーケンスをYSEQよりはるかに低価格で、さらにボーナス付きでご利用いただけます。 また、Nebula Genomicsは、最新の科学的発見に基づくアップデートを定期的に提供しています。 自分自身のことをもっと知りたい！という方は、ぜひこの機会にお求めください。 |
YSEQはどのように機能しますか？
YSEQサービスのレビュー：SNP、STR、およびハプログループの基礎
一塩基多型（SNP）とは、DNAの塩基配列が一塩基単位で異なることをいいます。 たとえば、2人の個人のDNA配列が一点で異なる場合、それはSNPと呼ばれます。
一方、短いタンデムリピート、またはSTRは、個人間で異なる一連の反復DNA配列です。 ゲノムの特定の領域での繰り返しの数を特定すると、「DNAフィンガープリント」を作成できます。 このゲノムフィンガープリントは、誰かの系図を決定するために使用される場合があります。
一緒に、SNPsとSTRは継承できるマーカーです。 このようなマーカーの組み合わせは、ハプロタイプと呼ばれる。 Y-DNAとmtDNAの検査で異なるハプロタイプの場合、特定の「ハプログループ」に振り分けられることがあります。 例えば、Y-DNA検査は父方の出自について詳しく知ることができますが、mtDNA検査は母方の系統について知ることができます。
YSEQが提供するサービスは、Y染色体とミトコンドリアDNAに見られるSTRとSNPのテストに基づいています。 この検査では、先祖の起源や共通の先祖に関連する遺伝子を明らかにすることができます。
Y染色体ハプログループ固定パネルやSTRマーカーパネルを多数ご用意しています。 さらに、カスタムハプログループパネルや、ほぼ無数にあるカスタムSNPsも用意されています。
ユーザーがDNAをYSEQに送信すると、さらに分析が必要になった場合に備えて、会社に保存されます。
YSEQY染色体ハプログループのレビュー
77の厳密なハプログループパネルと179のカスタムハプログループパネルから選択することができます。 それぞれが異なる祖先の起源を表しています。
YSEQでは、初めてご利用になるお客様には、すべてのハプログループを網羅した159ドルの「トップレベルオリエンテーションパネル」のご注文をお勧めしています。 このパネルでは、YSEQは複数回のテストを実行して、Y染色体の祖先ツリー内の正確な位置を決定します。
まず、M169とM9のどちらに属するかを判断します。 この情報が得られると、ツリーを下っていき、あなたのスーパークレードを決定します。 各スーパークレードは、異なる祖先の起源に対応しています。 たとえば、ハプログループD-M174は、東アジアとアンダマン諸島で見られます。
他の76の定義されたハプログループパネルはより具体的で、88ドルから99ドルの費用がかかります。 この場合も、他の検査の結果を参考にすることで、どのハプログループパネルを注文すればよいかを理解することができます。
例えば、Qスーパークレードパネルは、他のSTR検査でこの方向性を示しているユーザー向けのパネルです。 YSEQは、このパネルで定義されたマーカーについてユーザーをテストし、その後、先祖の木に沿って作業を進めます。
YSEQは、77の定義済みハプログループパネルに加えて、他のDNA検査サービスが提供するファミリーファインダーと同様に機能する179のカスタムパネルも提供しています。
これらのパネルは非常に特殊で、価格も高い（89ドル～509ドル）。 例えば、「Phelps」姓の由来には、E1a1-Z31503 Phelps Panelを推奨しています。 同様に、E1b-L1019 Goodrich Panelは、Goodrichという名前の人たちのためのパネルです。 YSEQは、このようなジェノグラフィープロジェクトに関心のある遺伝系譜学者にとって良い選択肢となります。
イギリス諸島に関連するジェノグラフィックプロジェクトに特に興味がある場合は、チェックアウトする必要があります生きているDNA 。
YSEQ Y染色体STR、SNP、およびパネルのレビュー
YSEQでは、9種類の複合STRパネル（25～99ドル）、125種類の特定STR（9.95～15ドル）、131,611種類のSNP（各1ドル）から選択することができます。 SNPテストが利用できない場合、ユーザーは特別なリクエストをすることができます。 各SNPは異なるハプログループに対応しているため、ユーザーは自分だけのハプログループパネルを作成して検査することができます。
ただし、このレベルのカスタマイズ可能なテストには、ある程度の事前知識と調査が必要です。 ユーザーは、具体的な家系を知り、予備検査を受け、さらに調査したいハプログループを正確に把握する必要があります。
YSEQmtDNAテストのレビュー
YSEQでは4種類のmtDNA検査が可能です。 ミトコンドリア超変異領域1（HPV1、25ドル）と領域2（HPV2、25ドル）の2種類の検査があります。 ユーザーは、ミトコンドリアDNA全体の検査（145ドル）や、HPV1またはHPV2からミトコンドリアDNA全体へのアップグレード（115ドル）を行うことも可能です。
また、ミトコンドリアDNAの特定領域に対応した30種類のmtDNAカスタムパネル（15ドル～60ドル）も追加されています。
YSEQ全ゲノムシーケンスのレビュー
YSEQでは、家系図研究者向けに、3つのレベルのフルゲノムシーケンスを提供しています。 YSEQチームはサンプルを受け取ると、DNA濃度を測定し、品質管理を行う。 その後、NovaSeq 6000プラットフォームでのシーケンシングに回されます。 最後に、生のDNA FASTQファイルから、すべてのY染色体SNPをアノテーションし、mtDNAハプログループを提供します。
- 45GBの全ゲノム配列：579ドル、15倍のカバレッジを提供。
- 全ゲノム配列 90Gbases: $929, 30倍のカバレッジを提供します。
- 全ゲノム配列（150Gbases）：1559ドル、50倍のカバレッジを提供します。
YSEQは、DNAデータの医学的・健康的な解析は一切行いません。
YSEQ結果のレビュー
YSEQはDNAの解析や解釈は行いませんが、ユーザーは報告されたハプログループに対して陽性か陰性かを確認することができます。 また、ユーザーはSNPsについて、祖先由来（ネガティブ）か由来（ポジティブ）かを確認するための表も得ることができます。
YSEQは、全ゲノムシーケンスの結果ページで、データ中に見つかったSNPとその祖先の状態のリストをユーザーに提供します。
ユーザーは、さらなる分析が必要な場合、データを第三者のウェブサイト（YFullなど）にエクスポートすることができます。
YSEQデータのダウンロード
お客様は全ゲノムシーケンスデータをダウンロードするか、マイクロSDカードで郵送してもらうことができます。 ただし、YSEQでは、Y染色体やmtDNAのデータのダウンロードに関する情報は提供しておらず、データ形式も指定していない。
YSEQプライバシーのレビュー
ユーザーがYSEQに送ったDNAは、テキサス州ヒューストンで保管・処理され、さらなる分析が必要となった場合に備えています。 ユーザーがサンプルを送付し、サービスを申し込んだ時点で、社内研究開発のためにデータを使用することに自動的に同意したことになります。
この声明では、特定のサービスに対してユーザーが署名する同意書について触れています。 特定のサービスに関する同意書が存在しない場合は、プライバシーポリシーが適用されます。
YSEQは、すべての責任をもって、個人情報を保護します。 しかし、「[YSEQ] 、家系図作成に使えるDNAデータベースライブラリを構築するのに十分な一般情報を公開」しています。
ユーザーの同意があれば、このデータを生物学的研究のために使用することができます。 お客様の情報は、YSEQからの明確な要求がない限り、匿名化されます。
ニュースのYSEQ
祖先の遺伝学と系図学を専門とするDNA検査会社として、YSEQはニュースで特に取り上げられていません。 イタリアのニュースウェブサイトに掲載されているいくつかの記事は次のとおりです。
- 「「Gli abitanti di Sassalbo？ Origini dal Mar Caspio」。 （「サッサルボの住民？カスピ海からの起源」）
- 「「 Dal Medioevo ai giorni nostri：ho ricostruito l’albero genealogico dei Donadoni 」。 （「中世から現在まで：ドナドーニ家系図を再構築しました」）
その他のYSEQレビュー
同社は、オンライン上で第三者によるレビューがあまりありません。 しかし、ホームページには、お客様が作成したレビューが約250件掲載されています。 評価は1つ星から5つ星まであります。
低い評価をしたお客さまは、待ち時間の長さを指摘しています。 高評価者は興味深い結果を共有し、多くの人が疑わしかった起源を確認したと述べています。
星雲ゲノミクス
Nebula Genomicsは、YSEQや他の遺伝子検査会社とは異なり、豊富なデータ解析の提供に重点を置いているのが特徴です。 このデータ解析は、染色体の1つまたは2つの領域だけでなく、ゲノム全体に拡張することができます。
私たちは、お客様が当社のウェブサイト上で最高の体験をされることを望んでいます。 ゲノム探索ツールへのフルアクセスにより、隠れた料金やコストを心配することなく、いつでも遺伝子データを解析することができます。 他社とは異なり、最新の研究成果を用いて、定期的にお客様の遺伝子レポートを更新しています。 さらに、私たちのレポートには、単なる遺伝的祖先以上のものが含まれています。
あなたのためのより少ない努力
祖先であろうと健康であろうと、私たちはあなたのために研究を行います。 私たちの直感的なインターフェースにより、最小限の労力でDNAデータのロックを解除して理解することができます。
優れたデータには大きな責任が伴います
Nebula Genomicsでは、お客様のプライバシーを何よりも理解し、尊重しています。 データの所有権と管理は、あなたの手に委ねられています。 データを研究者と共有することを選択した場合は、報酬を選択することができます。
データは安全なサーバーに保存され、常に暗号化されます。 あなたはの重要性についてもっと読むことができますDNAプライバシー。
星雲拡張による単なる祖先以上のもの
すでに他社のDNAデータをお持ちですか？ アップロードしていただくと、Nebula Genomicsの拡張レポートを受け取ることができます。 私たちのレポートは、マイクロアレイに基づくDNAジェノタイピング法を使用する他の遺伝子会社よりも多くの情報を提供します。 私たちは、インピュテーションと呼ばれる高度な統計モデルを使って、空白を埋めることができます。
個々の遺伝形質について限られた静的なレポートを持つのではなく、当社のレポートは定期的に更新されます。 ネビュラリサーチライブラリーの数百の形質を、隠れた手数料なしですぐに利用することができます。
Nebula Genomics30x全ゲノムシーケンス
私たちの目標は常にあなたの手に力を与えることでした。
他社のDNA検査方法では、ゲノムの一部からしかデータを得ることができません。 このデータは多くの場合、 1染色体。
これは、貴重な情報を見逃す可能性があることを意味します。 30倍速全ゲノムシークエンスサービスでは、お客様のDNAを100％読み取ります。 その1万倍ものデータを使って、充実したレポートをお届けしています。
DNA検査に最適な場所を選ぶことは非常に重要な決定です。 決定を少し簡単にするために、YSEQ、23andMe、AncestryDNA、およびNebulaGenomicsの比較を示します。
| YSEQ | 23andMe | AncestryDNA | 星雲ゲノミクス | |
| DNA検査法 | Y染色体シーケンシング、mtDNAシーケンシング、全ゲノムシーケンシング（15x-50xカバレッジ） | ジェノタイピング | ジェノタイピング | 30倍速WGS |
| DNAレポート | 提供されていない | 1つの完全なレポート | 1つの完全なレポート | 定期的に更新される拡張レポート |
| Y-DNA、mtDNA、および祖先レポート | ただし、mtDNAとY DNAを別々に購入する必要があります。 ユーザーは独自の調査を行う必要があります。 | はい | はい | Y染色体およびmtDNAの完全なシークエンスによるディープ・アドレストリーレポート |
| データの所有権 | データが誰に属しているか不明 | 不明。 お客様の唾液サンプルを破棄していただくことが可能です | 不明。 お客様はDNAとデータを削除/破棄できます | あなたのデータは永久にあなたのものです |
| プライバシーに焦点を当てる | はい | 番号 | 番号 | はい（詳しくはホームページでご確認ください） |
| 使用されるセキュリティ技術 | 不明 | SSLなどの標準的なセキュリティプロトコル | SSLなどの標準的なセキュリティプロトコル | ブロックチェーン、プライバシー保護コンピューティング |
| データアップロードオプション | 有償 | 番号 | 番号 | はい。 代入により、拡張レポートが可能になります |
| 新しい研究に基づく無料アップデート | 番号 | 番号 | 番号 | 定期的にレポートが更新されます。 |
| データを探索するためのツール | なし | 限定 | 限定 | はい （もっと詳しく知る） |
| データアクセス | データのダウンロードは可能だが、フォーマットが不明である | はい（23andMe形式のファイル） | はい（AncestryDNAフォーマットファイル） | はい（FASTQ、BAM、およびVCFファイル） |
| 費用 | 個々のニーズに応じて異なります。 1559ドルと高い場合もある | 99ドルまたは199ドル | 99ドルまたは119ドル | $ 0、$ 99、$ 299 |
シーケンスの重要性について詳しくは、ブログをご覧ください。 Y-DNAとmtDNAそして親子鑑定。
全ゲノムシーケンスに興味がありますか？ あなたはこれらの他の製品をチェックすることができます：
- 24Genetics(全ゲノムシークエンス)
- カラー（ローカバレッジ全ゲノムシークエンス可能）
- Dante Labs社（30倍速全ゲノムシークエンス、ほとんどのレポートは有料）
- フルゲノム（データのアップロードまたは包括的なレポートのためのテストのオプション）
- Mapmygenome（インドでのみ利用可能）
- PerkinElmer Genomics （WES、WGS、新生児スクリーニングなど）
- Sequencing.com（全ゲノムシークエンス）
- Veritas Genetics（30倍速全ゲノムシークエンスと高度診断薬）
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