Resumo da revisão YSEQ
Resumo
O YSEQ usa vários produtos de sequenciamento de última geração para analisar o DNA. No entanto, eles tendem a ser mais caros do que os concorrentes e a interface pode ser difícil de navegar.
Índice
Editado por Christina Swords, Ph.D.
7 fatos de nossa revisão YSEQ
- Localização YSEQ : Alemanha
- Serviços : vários produtos de sequenciamento de última geração (teste de DNA do cromossomo Y, mtDNA e sequenciamento do genoma completo)
- Download de dados : download de dados brutos de DNA disponível
- Relatórios: Produtos de sequenciamento personalizados, sem relatórios de interpretação de DNA
- Privacidade : as amostras são destruídas e os dados são excluídos mediante solicitação
- Custo: varia de menos $ 100 a mais de $ 1500
- Alternativas: Nebula Genomics (o sequenciamento completo do genoma 30x mais acessível)
Introdução ao YSEQ
Esta é uma análise da YSEQ, uma empresa de testes genéticos direto ao consumidor que oferece principalmente serviços e testes de sequenciamento do cromossomo Y. Foi fundado por Thomas e Astrid Krahn. Nos anos mais recentes, a empresa se expandiu e agora também oferece testes de DNA mitocondrial (mtDNA) e de DNA autossômico (sequenciamento do genoma completo). Com sede na Alemanha, o YSEQ foi criado em 2013 por Thomas Krahn e Astrid Krahn, que eram ex-funcionários da Family Tree DNA.
Com o YSEQ, os usuários têm total poder para decidir as regiões exatas do cromossomo Y ou mtDNA que desejam sequenciar. Fiel ao slogan da empresa, “YSEQ: DNA Origins Project”, a maioria dos usuários usa este serviço para entender melhor sua ancestralidade. Embora a empresa ofereça uma gama impressionante de opções de sequenciamento customizado, ela não oferece relatórios com interpretação de DNA. A maioria dos usuários usa serviços de terceiros, como YFull , para interpretar seus dados brutos.
Como funciona o YSEQ?
Revisão dos serviços do YSEQ: Noções básicas de SNPs, STRs e haplogrupos
Polimorfismos de nucleotídeo único , ou SNPs, são diferenças nas sequências de DNA ao nível de um único nucleotídeo. Por exemplo, quando as sequências de DNA de dois indivíduos diferem em um único ponto, isso é chamado de SNP.
Por outro lado, curtas repetições tandem , ou STRs, são uma série de sequências de DNA repetidas que diferem entre os indivíduos. Identificar o número de repetições em áreas específicas do genoma pode criar uma “impressão digital de DNA”. Esta impressão digital genômica pode ser usada para determinar a genealogia de alguém.
Juntos, SNPs e STRs são marcadores que podem ser herdados; uma combinação de tais marcadores é conhecida como um haplótipo . Existem diferentes testes de Y-DNA e mt-DNA para diferentes haplótipos, que podem atribuir pessoas a um “ haplogrupo ”. Enquanto os testes de Y-DNA podem nos dizer mais sobre as origens paternas, os testes de mtDNA nos falam sobre as origens maternas.
Os serviços oferecidos pelo YSEQ são baseados no teste de STRs e SNPs encontrados no cromossomo Y e no DNA mitocondrial. O teste pode dizer às pessoas mais sobre suas origens ancestrais e genes associados a ancestrais comuns.
Você pode escolher entre um grande número de painéis de haplogrupo do cromossomo Y fixos e painéis de marcadores STR. Também há painéis de haplogrupo personalizados e um número quase infinito de SNPs personalizados.
Uma vez que os usuários enviam seu DNA ao YSEQ, ele é armazenado com a empresa, caso sejam necessárias análises adicionais.
Revisão dos haplogrupos do cromossomo YSEQ Y
Existem 77 estritos painéis de haplogrupo e 179 painéis de haplogrupo personalizados escolher a partir de. Cada um representa origens ancestrais diferentes.
YSEQ recomenda que os usuários iniciantes solicitem o Painel de orientação de nível superior , que custa US $ 159 e cobre todos os haplogrupos. Neste painel, o YSEQ faz várias rodadas de testes para determinar sua posição exata na árvore ancestral do cromossomo Y.
Eles primeiro determinam se você pertence à categoria M169 ou M9. Assim que essa informação estiver disponível, eles descem na árvore para determinar seu superclado. Cada superclado corresponde a diferentes origens ancestrais. Por exemplo, o Haplogrupo D-M174 é encontrado no Leste Asiático e nas Ilhas Andaman.
Os outros 76 painéis de haplogrupo definidos são mais específicos e custam entre US $ 88 e US $ 99. Os resultados anteriores de outros testes podem ajudar os usuários a entender qual painel de haplogrupo específico eles gostariam de solicitar.
Por exemplo, o Painel Q Superclade é para usuários que têm outros testes de STR que os apontam nessa direção. Neste painel, o YSEQ testará os usuários para definir marcadores e, em seguida, trabalhará para baixo na árvore ancestral.
Além dos 77 painéis de haplogrupo definidos, o YSEQ também oferece 179 painéis personalizados que funcionam de forma semelhante aos localizadores de família oferecidos por outros serviços de teste de DNA. Esses painéis são altamente específicos e mais caros ($ 89 – $ 509). Por exemplo, o Painel Phelps E1a1-Z31503 é especificamente recomendado para a origem do sobrenome “Phelps”. Da mesma forma, o Painel Goodrich E1b-L1019 é para pessoas com o sobrenome Goodrich. O YSEQ é uma boa opção para genealogistas genéticos interessados em tais projetos genográficos.
Se você está particularmente interessado em projetos genográficos relacionados às Ilhas Britânicas, você também deve verificar DNA vivo .
Revisão dos STRs, SNPs e painéis do cromossomo YSEQ Y
Ofertas YSEQ 9 painéis STR combinados ($ 25- $ 99), 125 STRs específicos ($ 9,95- $ 15), e 131.611 SNPs ($ 1 cada) para escolher. Se houver um SNP que não esteja disponível, os usuários podem fazer uma solicitação especial. Como cada SNP corresponde a um haplogrupo diferente, os usuários podem criar seu próprio painel de haplogrupo personalizado para teste.
No entanto, este nível de teste personalizável requer uma certa quantidade de conhecimento prévio e pesquisa. Os usuários precisam saber sua história familiar específica, fazer exames anteriores e saber o haplogrupo exato que desejam investigar.
Revisão dos testes de mtDNA do YSEQ
Ofertas YSEQ 4 testes de mtDNA YSEQ . Dois dos testes YSEQ são para a região 1 hipervariável mitocondrial (HPV1, $ 25) e região 2 (HPV2, $ 25). Os usuários também podem testar todo o seu DNA mitocondrial (US $ 145) ou atualizar do HPV1 ou HPV2 para o DNA mitocondrial completo (US $ 115).
Existem também 30 adicionais Painéis personalizados mtDNA , correspondendo a regiões específicas do DNA mitocondrial ($ 15- $ 60).
Revisão do sequenciamento completo do genoma do YSEQ
Ofertas YSEQ três níveis de sequenciamento completo do genoma, especificamente para pesquisadores de genealogia. Assim que a equipe do YSEQ recebe a amostra, eles medem a concentração de DNA e conduzem o controle de qualidade. Feito isso, eles o enviam para sequenciamento em uma plataforma NovaSeq 6000. A partir dos arquivos FASTQ brutos do DNA, eles anotam todos os SNPs do cromossomo Y e fornecem haplogrupos mtDNA.
- Sequência do genoma completo 45 GBases: $ 579, oferece cobertura 15x
- Sequência de genoma completo 90 Gbases: $ 929, oferece cobertura 30x
- Sequência de genoma completo 150 Gbases: $ 1559, oferece cobertura 50x
Nenhuma análise médica ou de saúde dos dados de DNA é conduzida pelo YSEQ.
Revisão dos resultados do YSEQ
O YSEQ não faz nenhuma análise ou interpretação de DNA para amostras de DNA do usuário. Os usuários podem ver se o teste é positivo ou negativo para os haplogrupos relatados. Os usuários também recebem uma tabela onde podem ver se são ancestrais (negativos) ou derivados (positivos) para SNPs.
Para o sequenciamento completo do genoma, o YSEQ fornece aos usuários páginas de resultados que incluem uma lista de SNPs encontrados nos dados, com seus estados ancestrais.
Os usuários podem exportar seus dados para sites de terceiros (como YFull ) se quiserem fazer uma análise mais aprofundada.
Baixando seus dados YSEQ
Os dados completos do sequenciamento do genoma podem ser baixados ou enviados ao usuário em um cartão micro SD. YSEQ não fornece informações sobre como baixar os dados do cromossomo Y ou mtDNA e não especifica formatos de dados.
Revisão da privacidade do YSEQ
Uma vez que os usuários enviam seu DNA ao YSEQ, ele é armazenado com a empresa, caso sejam necessárias análises adicionais. Os usuários podem optar por enviar um e-mail para a empresa e ter suas amostras destruídas.
De acordo com Declaração de privacidade YSEQ , eles assumem toda a responsabilidade de manter as informações pessoais privadas. No entanto, eles tornam “público suficiente de informações gerais para permitir[them] construir uma biblioteca de banco de dados de DNA utilizável para fins genealógicos ”.
Com o consentimento do usuário, esses dados podem ser usados para fins de pesquisa biológica.
YSEQ nas notícias
Como uma empresa de testes de DNA especializada em genética ancestral e genealogia, a YSEQ não foi particularmente noticiada. Aqui estão alguns artigos, apresentados em sites de notícias italianos:
- “Gli abitanti di Sassalbo? Origini dal Mar Caspio”. (“Os habitantes de Sassalbo? Origens do Mar Cáspio”)
- “ Dal Medioevo ai giorni nostri: ho ricostruito l’albero genealogico dei Donadoni ”. (“Da Idade Média aos dias atuais: Eu reconstruí a árvore genealógica Donadoni”)
Comentários YSEQ
- Análise YSEQ por cruwys: YSEQ.net – uma nova empresa que oferece um único serviço de teste SNP
- Revisão do YSEQ pelo filogeógrafo: Qual teste responderá melhor às suas perguntas?
Novos preços WGS competitivos do YSEQ - Revisão do YSEQ por learnalittleeveryday: De STRs a SNPs – Uma atualização sobre meu teste de yDNA
Prós e contras do YSEQ
| Prós | Contras |
| – Um número incrível de opções para testes de DNA do cromossomo Y, com muito espaço para personalização. – YSEQ torna mais fácil restringir a ancestralidade do usuário, com muitos testes diferentes para fazer isso. – O sequenciamento completo do genoma está disponível como uma opção com cobertura muito alta (50x). – Os usuários podem solicitar seus próprios SNPs e STRs. | – As opções não são tão extensas para o mtDNA ou sequenciamento completo do genoma. – Os custos podem aumentar à medida que mais testes de acompanhamento são feitos com os mesmos dados. – Os usuários precisam fazer suas próprias pesquisas para interpretar os dados ou pagar um dinheiro extra para ferramentas de análise de DNA de terceiros. – Sequenciamento completo do genoma muito caro. – O site é difícil de navegar. |
Nebula Genomics
Concluímos nossa análise YSEQ comparando os testes de DNA do YSEQ com a Nebula Genomics e outras empresas de testes de DNA.
A Nebula Genomics é diferente da YSEQ e de outras empresas de testes genéticos por se concentrar em fornecer análises extensas de dados. Essa análise de dados pode se estender a todo o genoma, em vez de apenas uma ou duas regiões de um cromossomo.
Nosso objetivo é proporcionar a você a melhor experiência em nosso site. Com acesso total às ferramentas de exploração do genoma, você pode analisar seus dados genéticos a qualquer momento, sem temer taxas ou custos ocultos. Ao contrário de outras empresas, usamos as pesquisas mais recentes para atualizar seus relatórios genéticos todas as semanas. Além disso, nossos relatórios contêm muito mais do que apenas ancestralidade genética.
Menos esforço para você
Quer se trate de ancestrais ou de saúde, faremos a pesquisa por você. Você não precisa fazer nenhuma pesquisa adicional para entender seus resultados. Nossa interface intuitiva permite que você desbloqueie e entenda seus dados de DNA com o mínimo de esforço.
Com grandes dados, vem uma grande responsabilidade
Na Nebula Genomics, entendemos e valorizamos sua privacidade acima de tudo. A propriedade e o controle sobre seus dados estão exclusivamente em suas mãos. Se você optar por compartilhar seus dados com os pesquisadores, pode escolher ser compensado.
Seus dados são armazenados em servidores seguros e sempre criptografados. Você pode ler mais sobre a importância de Privacidade de DNA .
Mais do que apenas ancestralidade com expansão de nebulosa
Já tem dados de DNA de outras empresas? Você pode enviar seus dados de DNA para receber um Relatório expandido da Nebula Genomics . Nossos relatórios fornecem mais informações do que outras empresas de genética, que usam métodos de genotipagem de DNA baseados em microarrays. Podemos preencher as lacunas usando nossos modelos estatísticos avançados, chamados de imputação.
Em vez de ter relatórios limitados e estáticos para características genéticas individuais, nossos relatórios são atualizados semanalmente. Você tem acesso imediato a centenas de características no Nebula Research Library , sem taxas ocultas.
Nebula Genomics 30x Sequenciamento do Genoma Completo (NOVO!)
Nosso objetivo sempre foi colocar o poder em suas mãos.
Os métodos de teste de DNA usados por outras empresas fornecem apenas dados de um parte do seu genoma. Esses dados muitas vezes podem ser apenas de 1 cromossoma.
Isso significa que você pode perder informações valiosas. Com nosso novo sequenciamento de genoma completo 30x serviço, lemos 100% do seu DNA. Em outras palavras, você analisa um quadro mais completo do seu DNA. Podemos fornecer 10.000 vezes mais dados, que usamos para fornecer um relatório abrangente.
Escolher o melhor lugar para o seu teste de DNA é uma decisão muito importante. Para tornar a decisão um pouco mais fácil, aqui está uma comparação de YSEQ, 23andMe, AncestryDNA e Nebula Genomics.
| YSEQ | 23andMe | AncestryDNA | Nebula Genomics | |
| Método de teste de DNA | Sequenciamento do cromossomo Y, sequenciamento do mtDNA, sequenciamento do genoma completo (cobertura 15x-50x) | Genotipagem | Genotipagem | Sequenciamento do genoma completo (cobertura de 30x) |
| Relatórios de DNA | Não fornecido | Um relatório completo | Um relatório completo | Um relatório estendido que é atualizado semanalmente |
| Relatórios de Y-DNA, mtDNA e Ancestry | Sim, mas tem que comprar o mtDNA e o DNA Y separadamente. Os usuários precisam fazer suas próprias pesquisas. | sim | sim | Relatórios de ancestralidade profunda com um cromossomo Y completo e sequenciamento de mtDNA com resultados de FTDNA |
| Propriedade de dados | Não está claro a quem pertencem os dados. | Não está claro. O cliente pode ter a saliva destruída. | Não está claro. O cliente pode excluir / destruir DNA e dados. | Seus dados pertencem permanentemente a você |
| Foco na privacidade | sim | Não | Não | Sim você pode saiba mais em nosso site ) |
| Tecnologia de segurança usada | Obscuro | Protocolos de segurança padrão como SSL. | Protocolos de segurança padrão como SSL. | Blockchain, computação que preserva a privacidade |
| Opções de upload de dados | Sim, com uma taxa. | Não | Não | Sim. Imputação permite um relatório expandido |
| Atualizações gratuitas com base em novas pesquisas | Não. | Não. | Não. | Há atualizações semanais no relatório ( Saber mais ) |
| Ferramentas para explorar dados | Nenhum. | Limitado | Limitado | Sim ( Saber mais ) |
| Acesso de dados | Os dados podem ser baixados, mas o formato não é claro. | Sim (arquivo de formato 23andMe). | Sim (arquivo de formato AncestryDNA). | Sim (arquivos FASTQ, BAM e VCF). |
| Custo | Varia de acordo com as necessidades individuais. Pode ser tão alto quanto $ 1559. | $ 99, $ 199 ou $ 499. | $ 99 ou $ 149. | $ 0 – $ 299 |
Confira mais no blog para saber mais sobre a importância do sequenciamento Y-DNA e mtDNA e teste de paternidade .
Interessado no sequenciamento do genoma completo? Você pode verificar estes outros produtos:
- Color Genomics (sequenciamento do genoma completo de baixa cobertura disponível)
- Dante Labs (US $ 599 por 30x sequenciamento do genoma inteiro, a maioria dos relatórios está disponível por um custo adicional)
- Genomas completos (US $ 75 para fazer upload de dados – US $ 2.900 para a leitura de DNA mais abrangente)
- Sano Genetics (upload gratuito; sequenciamento do genoma inteiro $ 1200)
- Sequencing.com ($ 399 para sequenciamento do genoma completo)
- Veritas Genetics ($ 599 para 30x sequenciamento do genoma completo – $ 3.599 para diagnósticos avançados)
- YSEQ ($ 929 para 30x sequenciamento do genoma completo)
Ou você gostaria de contribuir com a pesquisa genômica, mas ser compensado? Confira nosso nosso DNA Luna Reveja!
Gostou da nossa análise do YSEQ? Você pode ler mais críticas em nosso blog, incluindo YFull que oferece um produto semelhante, e confira nosso guia completo para o melhor kit de teste de DNA e outros testes caseiros .
