Resumo da revisão YSEQ
Resumo
A YSEQ utiliza múltiplos produtos de sequenciamento da próxima geração para analisar o ADN; contudo, tendem a ser mais caros do que os concorrentes e a interface pode ser difícil de navegar.
7 fatos de nossa revisão YSEQ
- Localização: Alemanha
- Serviços: Produtos múltiplos de sequenciação de próxima geração (teste de ADN do cromossoma Y, mtDNA, e sequenciação de todo o genoma)
- Descarga de dados: Descarregamento de dados de ADN bruto disponíveis
- Relatórios: Produtos de sequenciação personalizados; sem relatórios de interpretação de ADN
- Privacidade: Aplicação estrita da confidencialidade, mas aberta à divulgação de informações com a sua permissão ou sob outras circunstâncias urgentes
- Custo: Varia de menos $100 a mais de $1500
- Alternativas: Nebula Genomics (o sequenciamento completo do genoma 30x mais acessível)
Esta revisão foi escrita com a intenção de ser o mais imparcial possível. No entanto, representa a opinião de um revisor individual e, portanto, é subjetiva. Além disso, na Nebula Genomics procuramos educar o público sobre os benefícios do sequenciamento do genoma completo. As informações sobre nosso teste de DNA de sequenciamento de genoma completo são, portanto, incorporadas à revisão.
1 de Setembro de 2022
Índice
Editado por Christina Swords, Ph.D.
Prós e contras
Prós
- Um número incrível de opções para testes de DNA do cromossoma Y, com muito espaço para personalização
- O YSEQ facilita a redução da ancestralidade do utilizador, com muitos testes diferentes para o fazer
- A sequenciação completa do genoma está disponível como opção com uma cobertura muito elevada (50x)
- Os utilizadores podem solicitar os seus próprios SNPs e STRs
Contras
- As opções não são tão extensas para mtDNA ou sequenciação completa do genoma
- Os custos podem acumular-se à medida que mais testes de seguimento são feitos com os mesmos dados
- Os utilizadores precisam de fazer a sua própria investigação para interpretar os dados ou pagar dinheiro extra a ferramentas de análise de ADN de terceiros
- Sequenciação completa do genoma muito cara
- O website é difícil de navegar
Introdução
A YSEQ é uma empresa de testes genéticos directos ao consumidor que oferece principalmente testes e serviços de sequenciação de cromossomas Y.
Nos últimos anos, a empresa expandiu-se e oferece agora DNA mitocondrial (mtDNA) e testes de DNA autossómico (sequenciação de todo o genoma). Estas técnicas podem ser úteis para o rastreio da genealogia, tais como a genealogia indígena americana e a genealogia africana. Com sede na Alemanha, o YSEQ foi estabelecido em 2013 por Thomas e Astrid Krahn, antigos funcionários de DNA de Árvores Familiares.
Com o YSEQ, os usuários têm total poder para decidir as regiões exatas do cromossomo Y ou mtDNA que desejam sequenciar. Fiel ao lema da empresa, “YSEQ: DNA Origins Project,” atende aos utilizadores que querem compreender melhor a sua ascendência.
Embora a empresa ofereça uma gama impressionante de opções de sequenciação personalizadas, esta oferta não inclui relatórios com interpretação de ADN. Em vez disso, a maioria dos utilizadores deve utilizar serviços de terceiros, tais como o YFull, para interpretar os seus dados em bruto.
Como funciona o YSEQ?
Revisão dos serviços do YSEQ: Noções básicas de SNPs, STRs e haplogrupos
Polimorfismos de nucleótidos únicos, ou SNPs, são diferenças nas sequências de ADN a um único nível de nucleótidos. Por exemplo, quando as sequências de DNA de dois indivíduos diferem em um único ponto, isso é chamado de SNP.
Por outro lado, curtas repetições tandem , ou STRs, são uma série de sequências de DNA repetidas que diferem entre os indivíduos. Identificar o número de repetições em áreas específicas do genoma pode criar uma “impressão digital de DNA”. Esta impressão digital genômica pode ser usada para determinar a genealogia de alguém.
Juntos, SNPs e STRs são marcadores que podem ser herdados. Uma combinação de tais marcadores é conhecida como haplótipo. Diferentes testes Y-DNA e mtDNA para diferentes haplótipos podem atribuir pessoas a um “haplogrupo” específico. Por exemplo, enquanto os testes Y-DNA podem dizer-nos mais sobre as origens paternais, os testes mtDNA dizem-nos sobre as linhagens maternas.
Os serviços oferecidos pelo YSEQ são baseados no teste de STRs e SNPs encontrados no cromossomo Y e no DNA mitocondrial. O teste pode revelar origens ancestrais e genes associados a antepassados comuns.
Pode escolher entre muitos painéis fixos do grupo de haplogrupos de cromossomas Y e painéis de marcadores STR. Além disso, existem painéis de haplogroup personalizados e um número quase ilimitado de SNPs personalizados.
Uma vez que os usuários enviam seu DNA ao YSEQ, ele é armazenado com a empresa, caso sejam necessárias análises adicionais.
Revisão dos haplogrupos do cromossomo YSEQ Y
Existem 77 painéis de haplogroup estritos e 179 painéis de haplogroup personalizados à escolha. Cada um representa origens ancestrais diferentes.
A YSEQ recomenda que os primeiros utilizadores encomendem o Painel de Orientação de Alto Nível, que custa 159 dólares e cobre todos os haplogroups. Neste painel, o YSEQ faz várias rodadas de testes para determinar sua posição exata na árvore ancestral do cromossomo Y.
Primeiro determina se pertence à categoria M169 ou M9. Uma vez que esta informação esteja disponível, ela funciona pela árvore abaixo para determinar o seu super-clade. Cada superclado corresponde a diferentes origens ancestrais. Por exemplo, o Haplogrupo D-M174 é encontrado no Leste Asiático e nas Ilhas Andaman.
Os outros 76 painéis de haplogrupo definidos são mais específicos e custam entre US $ 88 e US $ 99. Mais uma vez, resultados anteriores de outros testes podem ajudar os utilizadores a compreender qual o painel de haplogroup específico que gostariam de encomendar.
Por exemplo, o Painel Q Superclade é para utilizadores que tenham outros testes STR que os apontem nessa direcção. O YSEQ testará os utilizadores para definir marcadores neste painel e depois trabalhará a sua descida pela árvore ancestral.
Além dos 77 painéis de haplogrupo definidos, o YSEQ também oferece 179 painéis personalizados que funcionam de forma semelhante aos localizadores de família oferecidos por outros serviços de teste de DNA.
Estes painéis são altamente específicos e mais caros ($89 – $509). Por exemplo, o Painel Phelps E1a1-Z31503 é recomendado para a origem do sobrenome “Phelps”. Da mesma forma, o Painel E1b-L1019 Goodrich é para pessoas chamadas Goodrich. O YSEQ é uma boa opção para genealogistas genéticos interessados em tais projectos genográficos.
Se você está particularmente interessado em projetos genográficos relacionados às Ilhas Britânicas, você também deve verificar DNA vivo .
Revisão dos STRs, SNPs e painéis do cromossomo YSEQ Y
YSEQ oferece 9 painéis STR combinados ($25-$99), 125 STR específicos ($9,95-$15), e 131,611 SNPs ($1 cada) para escolher. Se um teste SNP não estiver disponível, os utilizadores podem colocar um pedido especial. Uma vez que cada SNP corresponde a um haplogroup diferente, os utilizadores podem criar o seu painel de haplogroup personalizado para testes.
No entanto, este nível de teste personalizável requer uma certa quantidade de conhecimento prévio e pesquisa. Os utilizadores precisam de conhecer a sua história familiar específica, ter testes preliminares, e conhecer o grupo exacto que querem investigar mais aprofundadamente.
Revisão dos testes de mtDNA do YSEQ
A YSEQ oferece 4 testes de mtDNA. Dois testes são para a região mitocondrial hiper-variável 1 (HPV1, $25) e região 2 (HPV2, $25). Os utilizadores podem também testar todo o seu ADN mitocondrial ($145) ou actualizar de HPV1 ou HPV2 para o ADN mitocondrial completo ($115).
Há também mais 30 painéis personalizados de mtDNA correspondentes a regiões específicas do ADN mitocondrial ($15-$60).
Revisão do sequenciamento completo do genoma do YSEQ
O YSEQ oferece três níveis de sequenciação completa do genoma, especificamente para investigadores de genealogia. Assim que a equipa YSEQ recebe a amostra, mede a concentração de ADN e efectua o controlo de qualidade. Em seguida, envia-o para sequenciação numa plataforma NovaSeq 6000. Finalmente, a partir dos ficheiros em bruto de ADN FASTQ, anotam-se todos os SNPs cromossómicos Y e fornecem-se mtDNA haplogroups.
- Sequência do Genoma inteiro 45 GBases: $579, Proporciona 15x de cobertura
- Sequência do Genoma Inteiro 90 Gbases: $929, Proporciona 30x de cobertura
- Sequência do Genoma Inteiro 150 Gbases: $1559, Proporciona uma cobertura de 50x
A YSEQ não efectua análises médicas ou de saúde dos dados de ADN.
Revisão dos resultados do YSEQ
Embora o YSEQ não faça qualquer análise ou interpretação de ADN, os utilizadores podem ver se os testes são positivos ou negativos para os haplogroups notificados. Os utilizadores também recebem uma tabela para ver se são ancestrais (negativos) ou derivados (positivos) para os SNPs.
O YSEQ fornece aos utilizadores páginas de resultados para sequenciação de todo o genoma que incluem uma lista de SNPs encontrados nos dados com os seus estados ancestrais.
Os utilizadores podem exportar os seus dados para websites de terceiros (tais como YFull) se quiserem uma análise mais aprofundada.
Baixando seus dados YSEQ
Os clientes podem descarregar os seus dados de sequenciamento de todo o genoma ou recebê-los pelo correio num cartão micro SD. Contudo, o YSEQ não fornece informações sobre o descarregamento dos dados do cromossoma Y ou mtDNA e não especifica formatos de dados.
Revisão da privacidade do YSEQ
Assim que os utilizadores enviam o seu ADN ao YSEQ, este é armazenado e processado em Houston, Texas, no caso de ser necessária uma análise mais aprofundada. Quando os utilizadores enviam uma amostra e solicitam o serviço, consentem automaticamente a utilização dos seus dados para investigação e desenvolvimento interno.
A declaração menciona um formulário de consentimento que os utilizadores assinam para serviços específicos. Se não houver um formulário de consentimento para um determinado serviço, a Política de Privacidade mantém-se.
A YSEQ assume toda a responsabilidade de manter a informação pessoal privada. No entanto, torna “pública informação geral suficiente para permitir [YSEQ] construir uma biblioteca de base de dados de ADN utilizável para fins genealógicos”.
Com o consentimento do utilizador, estes dados podem ser utilizados para fins de investigação biológica. A sua informação será anónima, a menos que seja explicitamente solicitada pelo YSEQ.
YSEQ nas notícias
Como uma empresa de testes de DNA especializada em genética ancestral e genealogia, a YSEQ não foi particularmente noticiada. Aqui estão alguns artigos, apresentados em sites de notícias italianos:
- “Gli abitanti di Sassalbo? Origini dal Mar Caspio”. (“Os habitantes de Sassalbo? Origens do Mar Cáspio”)
- “ Dal Medioevo ai giorni nostri: ho ricostruito l’albero genealogico dei Donadoni ”. (“Da Idade Média aos dias atuais: Eu reconstruí a árvore genealógica Donadoni”)
Outras revisões YSEQ
A empresa não tem muitas análises de terceiros online. No entanto, há cerca de 250 revisões geradas por clientes no seu sítio web. As classificações variam de 1 a 5 estrelas.
Os clientes que deram revisões mais baixas anotam os longos tempos de espera. Os revisores superiores partilharam resultados interessantes e muitos notaram que confirmavam as suspeitas de origem.
Nebula Genomics
A Nebula Genomics é diferente da YSEQ e de outras empresas de testes genéticos porque se concentra em fornecer análises extensivas de dados. Esta análise de dados pode estender-se a todo o genoma em vez de apenas uma ou duas regiões de um cromossoma.
Queremos que tenha a melhor experiência no nosso website. Com acesso total às ferramentas de exploração do genoma, pode analisar os seus dados genéticos em qualquer altura sem receio de taxas ou custos ocultos. Ao contrário de outras empresas, utilizamos as mais recentes pesquisas para actualizar regularmente os seus relatórios genéticos. Além disso, nossos relatórios contêm muito mais do que apenas ancestralidade genética.
Menos esforço para você
Quer se trate de ancestrais ou de saúde, faremos a pesquisa por você. Nossa interface intuitiva permite que você desbloqueie e entenda seus dados de DNA com o mínimo de esforço.
Com grandes dados, vem uma grande responsabilidade
Na Nebula Genomics, entendemos e valorizamos sua privacidade acima de tudo. A propriedade e o controle sobre seus dados estão exclusivamente em suas mãos. Se você optar por compartilhar seus dados com os pesquisadores, pode escolher ser compensado.
Seus dados são armazenados em servidores seguros e sempre criptografados. Você pode ler mais sobre a importância de Privacidade de DNA .
Mais do que apenas ancestralidade com expansão de nebulosa
Já tem dados de DNA de outras empresas? Pode carregá-lo para receber um relatório expandido da Nebula Genomics. Nossos relatórios fornecem mais informações do que outras empresas de genética, que usam métodos de genotipagem de DNA baseados em microarrays. Podemos preencher os espaços em branco usando os nossos modelos estatísticos avançados, chamados imputação.
Em vez de ter relatórios limitados e estáticos para traços genéticos individuais, os nossos relatórios são actualizados regularmente. Tem acesso imediato a centenas de características na Biblioteca de Pesquisa da Nebulosa, sem taxas ocultas.
Nebula Genomics 30x Sequenciamento do Genoma Completo
Nosso objetivo sempre foi colocar o poder em suas mãos.
Os métodos de teste de ADN utilizados por outras empresas apenas fornecem dados de uma parte do seu genoma. Esses dados muitas vezes podem ser apenas de 1 cromossoma.
Isso significa que você pode perder informações valiosas. Com o nosso serviço de 30x Sequenciamento de Genoma Inteiro, lemos 100% do seu ADN. Trata-se de 10.000 vezes mais dados, que utilizamos para lhe dar um relatório extenso.
Escolher o melhor lugar para o seu teste de DNA é uma decisão muito importante. Para tornar a decisão um pouco mais fácil, aqui está uma comparação de YSEQ, 23andMe, AncestryDNA e Nebula Genomics.
| YSEQ | 23andMe | AncestryDNA | Nebula Genomics | |
| Método de teste de DNA | Sequenciamento do cromossomo Y, sequenciamento do mtDNA, sequenciamento do genoma completo (cobertura 15x-50x) | Genotipagem | Genotipagem | 30x WGS |
| Relatórios de DNA | Não fornecido | Um relatório completo | Um relatório completo | Um relatório alargado que é actualizado regularmente |
| Relatórios de Y-DNA, mtDNA e Ancestry | Sim, mas é necessário adquirir o mtDNA e o ADN Y separadamente. Os usuários precisam fazer suas próprias pesquisas. | sim | sim | Relato de ancestralidade profunda com um cromossoma Y completo e sequenciação mtDNA |
| Propriedade dos dados | Não está claro a quem pertencem os dados | Não está claro. O cliente pode ter a sua amostra de saliva destruída | Não está claro. O cliente pode excluir / destruir DNA e dados | Seus dados pertencem permanentemente a você |
| Foco na privacidade | sim | Não | Não | Sim (Pode saber mais no nosso website) |
| Tecnologia de segurança usada | Obscuro | Protocolos de segurança padrão como SSL | Protocolos de segurança padrão como SSL | Blockchain, computação que preserva a privacidade |
| Opções de upload de dados | Sim, com uma taxa | Não | Não | Sim. Imputação permite um relatório expandido |
| Atualizações gratuitas com base em novas pesquisas | Não | Não | Não | Há actualizações regulares do relatório(saiba mais) |
| Ferramentas para explorar dados | Nenhum | Limitado | Limitado | Sim ( Saber mais ) |
| Acesso de dados | Os dados podem ser descarregados, mas o formato não é claro | Sim (arquivo de formato 23andMe) | Sim (arquivo de formato AncestryDNA) | Sim (arquivos FASTQ, BAM e VCF) |
| Custo | Varia de acordo com as necessidades individuais. Pode atingir os $1559 | $ 99 ou $ 199 | $ 99 ou $ 119 | $ 0, $ 99, $ 299 |
Confira mais no blog para saber mais sobre a importância do sequenciamento Y-DNA e mtDNA e teste de paternidade .
Interessado no sequenciamento do genoma completo? Você pode verificar estes outros produtos:
- 24Genetics (sequenciação de todo o genoma)
- Cor (baixa cobertura sequenciação de todo o genoma disponível)
- Dante Labs (30x sequenciação do genoma inteiro, a maioria dos relatórios estão disponíveis a um custo adicional)
- Genomas completos (opções para carregar dados ou testar para um relatório completo)
- Mapmygenome (apenas disponível na Índia)
- PerkinElmer Genomics (WES, WGS, triagem neonatal e mais)
- Sequenciamento.com (sequenciamento de todo o genoma)
- Veritas Genetics (30x sequenciação de todo o genoma e diagnóstico avançado)
Ou você gostaria de contribuir com a pesquisa genômica, mas ser compensado? Confira nosso Luna DNA review !
Gostou da nossa análise do YSEQ? Pode ler mais resenhas no nosso blog, incluindo YFull que oferece um produto semelhante, e consultar o nosso guia completo do melhor kit de teste de ADN e outros testes domésticos.
