Resumen de revisión de YSEQ
Resumen
YSEQ utiliza varios productos de secuenciación de próxima generación para analizar el ADN; sin embargo, suelen ser más caros que los de la competencia y la interfaz puede ser difícil de navegar.
7 hechos de nuestra revisión YSEQ
- Ubicación: Alemania
- Servicios: Múltiples productos de secuenciación de nueva generación (pruebas de ADN del cromosoma Y, ADNmt y secuenciación del genoma completo)
- Descarga de datos: Descarga de datos de ADN en bruto
- Informes: Productos de secuenciación personalizados; no hay informes de interpretación del ADN
- Privacidad: Aplicación estricta de la confidencialidad, pero abierta a la divulgación de información con su permiso o en otras circunstancias apremiantes
- El coste: Va desde menos de 100 dólares hasta más de 1.500 dólares.
- Alternativas: Genómica de la nebulosa (la secuenciación del genoma completo 30x más asequible)
Esta revisión está escrita con la intención de ser lo más imparcial posible. Sin embargo, representa la opinión de un revisor individual y, por lo tanto, es subjetiva. Además, en Nebula Genomics buscamos educar al público sobre los beneficios de la secuenciación del genoma completo. Por lo tanto, la información sobre nuestra prueba de ADN de secuenciación del genoma completo se incorpora a la revisión.
1 de septiembre de 2022
Tabla de contenido
Editado por Christina Swords, Ph.D.
Pros y contras
Pros
- Un número increíble de opciones para las pruebas de ADN del cromosoma Y, con mucho espacio para la personalización
- YSEQ facilita el acotamiento de la ascendencia del usuario, con muchas pruebas diferentes para hacerlo
- La secuenciación completa del genoma está disponible como opción con una cobertura muy alta (50x)
- Los usuarios pueden solicitar sus propios SNPs y STRs
Contras
- Las opciones no son tan amplias para la secuenciación del ADNmt o del genoma completo
- Los costes pueden acumularse a medida que se realizan más pruebas de seguimiento sobre los mismos datos
- Los usuarios tienen que hacer su propia investigación para interpretar los datos o pagar dinero extra a herramientas de análisis de ADN de terceros
- Secuenciación completa del genoma muy cara
- El sitio web es difícil de navegar
Introducción
YSEQ es una empresa de pruebas genéticas directas al consumidor que ofrece principalmente pruebas y servicios de secuenciación del cromosoma Y.
En los últimos años, la empresa se ha ampliado y ahora ofrece pruebas de ADN mitocondrial (ADNmt) y de ADN autosómico (secuenciación del genoma completo). Estas técnicas pueden ser útiles para rastrear la genealogía, como la de los nativos americanos y la de los descendientes de africanos. Con sede en Alemania, YSEQ fue creada en 2013 por Thomas y Astrid Krahn, antiguos empleados de Family Tree DNA.
Con YSEQ, los usuarios tienen pleno poder para decidir las regiones exactas del cromosoma Y o ADNmt que desean secuenciar. Fiel al eslogan de la empresa, «YSEQ: DNA Origins Project», se dirige a los usuarios que quieren conocer mejor su ascendencia.
Aunque la empresa ofrece una impresionante gama de opciones de secuenciación personalizada, esta oferta no incluye informes con interpretación del ADN. En cambio, la mayoría de los usuarios deben utilizar servicios de terceros, como YFull, para interpretar sus datos brutos.
¿Cómo funciona YSEQ?
Revisión de los servicios de YSEQ: conceptos básicos de SNP, STR y haplogrupos
Los polimorfismos de un solo nucleótido, o SNP, son diferencias en las secuencias de ADN a nivel de un solo nucleótido. Por ejemplo, cuando las secuencias de ADN de dos individuos difieren en un solo punto, se denomina SNP.
Por otra parte, repeticiones cortas en tándem , o STR, son una serie de secuencias de ADN repetidas que difieren entre individuos. Identificar el número de repeticiones en áreas específicas del genoma puede crear una «huella de ADN». Esta huella genómica puede usarse para determinar la genealogía de alguien.
Juntos, los SNP y los STR son marcadores que pueden heredarse. Una combinación de estos marcadores se conoce como haplotipo. Diferentes pruebas de ADN-Y y ADN-mt para diferentes haplotipos pueden asignar a las personas a un «haplogrupo» específico. Por ejemplo, mientras que las pruebas de ADN-Y pueden informarnos más sobre los orígenes paternos, las pruebas de ADN-mt nos informan sobre los linajes maternos.
Los servicios ofrecidos por YSEQ se basan en probar STR y SNP que se encuentran en el cromosoma Y y en el ADN mitocondrial. La prueba puede revelar los orígenes ancestrales y los genes asociados a los ancestros comunes.
Puede elegir entre muchos paneles de haplogrupos fijos del cromosoma Y y paneles de marcadores STR. Además, hay paneles de haplogrupos personalizados y un número casi infinito de SNP personalizados.
Una vez que los usuarios envían su ADN a YSEQ, se almacena con la empresa en caso de que se requieran más análisis.
Revisión de los haplogrupos del cromosoma Y de YSEQ
Hay 77 paneles de haplogrupos estrictos y 179 paneles de haplogrupos personalizados para elegir. Cada uno representa diferentes orígenes ancestrales.
YSEQ recomienda a los usuarios noveles que pidan el panel de orientación de nivel superior, que cuesta 159 dólares y cubre todos los haplogrupos. En este panel, YSEQ realiza múltiples rondas de pruebas para determinar su posición exacta en el árbol ancestral del cromosoma Y.
En primer lugar, determina si pertenece a la categoría M169 o M9. Una vez que se dispone de esta información, trabaja hacia abajo en el árbol para determinar su superclado. Cada superclado corresponde a diferentes orígenes ancestrales. Por ejemplo, el haplogrupo D-M174 se encuentra en Asia oriental y las islas Andaman.
Los otros 76 paneles de haplogrupos definidos son más específicos y cuestan entre $ 88 y $ 99. Una vez más, los resultados anteriores de otras pruebas pueden ayudar a los usuarios a entender qué panel de haplogrupo específico les gustaría pedir.
Por ejemplo, el panel Q Superclade es para los usuarios que tienen otras pruebas de STR que apuntan en esta dirección. YSEQ examinará a los usuarios para definir los marcadores en este panel y luego se abrirá camino hacia el árbol ancestral.
Además de los 77 paneles de haplogrupos definidos, YSEQ también ofrece 179 paneles personalizados que funcionan de manera similar a los buscadores de familias que ofrecen otros servicios de pruebas de ADN.
Estos paneles son muy específicos y más caros (89 – 509 dólares). Por ejemplo, el panel E1a1-Z31503 Phelps se recomienda para el origen del apellido «Phelps». Del mismo modo, el panel E1b-L1019 Goodrich es para las personas que se llaman Goodrich. YSEQ es una buena opción para los genealogistas genéticos interesados en este tipo de proyectos genográficos.
Si está particularmente interesado en proyectos genográficos relacionados con las Islas Británicas, también debería consultar ADN vivo .
Revisión de STR, SNP y paneles del cromosoma Y de YSEQ
YSEQ ofrece 9 paneles combinados de STR (entre 25 y 99 dólares), 125 STR específicos (entre 9,95 y 15 dólares) y 131.611 SNP (1 dólar cada uno) para elegir. Si una prueba SNP no está disponible, los usuarios pueden hacer una petición especial. Dado que cada SNP corresponde a un haplogrupo diferente, los usuarios pueden crear su panel de haplogrupo personalizado para las pruebas.
Sin embargo, este nivel de pruebas personalizables requiere una cierta cantidad de conocimiento e investigación previos. Los usuarios deben conocer su historia familiar específica, hacerse pruebas preliminares y saber el haplogrupo exacto que quieren investigar.
Revisión de las pruebas de ADNmt de YSEQ
YSEQ ofrece 4 pruebas de ADNmt. Hay dos pruebas para la región hipervariable mitocondrial 1 (VPH1, 25 dólares) y la región 2 (VPH2, 25 dólares). Los usuarios también pueden analizar su ADN mitocondrial completo (145 dólares) o pasar del VPH1 o VPH2 al ADN mitocondrial completo (115 dólares).
También hay otros 30 paneles personalizados de ADNmt que corresponden a regiones específicas del ADN mitocondrial (entre 15 y 60 dólares).
Revisión de la secuenciación completa del genoma de YSEQ
YSEQ ofrece tres niveles de secuenciación completa del genoma, específicamente para los investigadores de genealogía. Una vez que el equipo de YSEQ recibe la muestra, mide la concentración de ADN y realiza un control de calidad. A continuación, la envía para su secuenciación en una plataforma NovaSeq 6000. Por último, a partir de los archivos FASTQ de ADN en bruto, anota todos los SNP del cromosoma Y y proporciona los haplogrupos de ADNmt.
- Secuencia del genoma completo 45 GBases: 579 dólares, proporciona una cobertura 15x
- Secuencia del genoma completo de 90 Gbases: 929 dólares, proporciona una cobertura de 30x
- Secuencia del genoma completo de 150 Gbases: 1559 dólares, proporciona una cobertura de 50x
YSEQ no realiza ningún análisis médico o sanitario de los datos de ADN.
Revisión de los resultados de YSEQ
Aunque YSEQ no realiza ningún análisis o interpretación del ADN, los usuarios pueden ver si dan positivo o negativo en los haplogrupos indicados. Los usuarios también obtienen una tabla para ver si son ancestrales (negativos) o derivados (positivos) para los SNP.
YSEQ proporciona a los usuarios páginas de resultados para la secuenciación del genoma completo que incluyen una lista de SNPs encontrados en los datos con sus estados ancestrales.
Los usuarios pueden exportar sus datos a sitios web de terceros (como YFull) si desean un análisis más profundo.
Descarga de sus datos de YSEQ
Los clientes pueden descargar sus datos de secuenciación del genoma completo o recibirlos por correo en una tarjeta micro SD. Sin embargo, YSEQ no proporciona información sobre la descarga de los datos del cromosoma Y o del ADNmt y no especifica los formatos de los datos.
Revisión de la privacidad de YSEQ
Una vez que los usuarios envían su ADN a YSEQ, éste se almacena y se procesa en Houston (Texas), por si se requieren más análisis. Cuando los usuarios envían una muestra y solicitan el servicio, consienten automáticamente el uso de sus datos para la investigación y el desarrollo internos.
La declaración menciona un formulario de consentimiento que los usuarios firman para determinados servicios. Si no existe un formulario de consentimiento para un servicio concreto, la política de privacidad se mantiene.
YSEQ asume toda la responsabilidad de mantener la privacidad de la información personal. Sin embargo, hace «pública suficiente información general para permitir que [YSEQ] construya una biblioteca de bases de datos de ADN utilizable con fines genealógicos.»
Con el consentimiento del usuario, estos datos pueden utilizarse con fines de investigación biológica. Su información será anónima a menos que YSEQ lo solicite explícitamente.
YSEQ en las noticias
Como empresa de pruebas de ADN especializada en genética y genealogía ancestral, YSEQ no ha aparecido particularmente en las noticias. Aquí hay algunos artículos, presentados en sitios web de noticias italianos:
- «Gli abitanti di Sassalbo? Origini dal Mar Caspio”. («¿Los habitantes de Sassalbo? Orígenes del mar Caspio»)
- « Dal Medioevo ai giorni nostri: ho ricostruito l’albero genealogico dei Donadoni ”. (“Desde la Edad Media hasta nuestros días: reconstruí el árbol genealógico de Donadoni”)
Otros comentarios de YSEQ
La empresa no tiene muchos comentarios de terceros en línea. Sin embargo, hay unas 250 opiniones generadas por clientes en su sitio web. Las calificaciones van de 1 a 5 estrellas.
Los clientes que han dado opiniones más bajas destacan los largos tiempos de espera. Los revisores superiores compartieron resultados interesantes y muchos señalaron que confirmaban los orígenes sospechados.
Genómica de la nebulosa
Nebula Genomics se diferencia de YSEQ y de otras empresas de pruebas genéticas porque se centra en proporcionar un amplio análisis de datos. Este análisis de datos puede abarcar todo el genoma en lugar de sólo una o dos regiones de un cromosoma.
Queremos que tenga la mejor experiencia en nuestro sitio web. Con el acceso total a las herramientas de exploración del genoma, puede analizar sus datos genéticos en cualquier momento sin temer tasas o costes ocultos. A diferencia de otras empresas, utilizamos las investigaciones más recientes para actualizar regularmente sus informes genéticos. Además, nuestros informes contienen mucho más que solo ascendencia genética.
Menos esfuerzo para ti
Ya sea por ascendencia o salud, haremos la investigación por usted. Nuestra interfaz intuitiva le permite desbloquear y comprender sus datos de ADN con un mínimo esfuerzo.
Con grandes datos viene una gran responsabilidad
En Nebula Genomics, entendemos y valoramos su privacidad por encima de todo. La propiedad y el control de sus datos están únicamente en sus manos. Si elige compartir sus datos con investigadores, puede optar por recibir una compensación.
Sus datos se almacenan en servidores seguros y siempre están encriptados. Puede leer más sobre la importancia de Privacidad de ADN .
Más que solo ascendencia con Nebula Expand
¿Ya tienes datos de ADN de otras empresas? Puede cargarlo para recibir un informe ampliado de Nebula Genomics. Nuestros informes proporcionan más información que otras empresas de genética, que utilizan métodos de genotipado de ADN basados en microarrays. Podemos rellenar los espacios en blanco utilizando nuestros modelos estadísticos avanzados, llamados imputación.
En lugar de tener informes limitados y estáticos para rasgos genéticos individuales, nuestros informes se actualizan regularmente. Usted tiene acceso inmediato a cientos de rasgos en la Biblioteca de Investigación Nebula sin cargos ocultos.
Secuenciación del genoma completo de Nebula Genomics 30x
Nuestro objetivo siempre ha sido poner el poder en tus manos.
Los métodos de pruebas de ADN utilizados por otras empresas sólo proporcionan datos de una parte de su genoma. Estos datos a menudo pueden ser de uno cromosoma.
Esto significa que puede perderse información valiosa. Con nuestro servicio de secuenciación del genoma completo 30x, leemos el 100% de su ADN. Esto supone 10.000 veces más datos, que utilizamos para ofrecerle un informe exhaustivo.
Elegir el mejor lugar para su prueba de ADN es una decisión muy importante. Para facilitar un poco la decisión, aquí hay una comparación de YSEQ, 23andMe, AncestryDNA y Nebula Genomics.
| YSEQ | 23andMe | AncestryDNA | Genómica de la nebulosa | |
| Método de prueba de ADN | Secuenciación del cromosoma Y, secuenciación del mtDNA, secuenciación del genoma completo (cobertura 15x-50x) | Genotipado | Genotipado | 30x WGS |
| Informes de ADN | No provisto | Un informe completo | Un informe completo | Un informe ampliado que se actualiza periódicamente |
| Informes de ADN Y, ADNmt y ascendencia | Sí, pero tiene que comprar el ADNmt y el ADN Y por separado. Los usuarios deben hacer su propia investigación. | si | si | Informe de ascendencia profunda con una secuenciación completa del cromosoma Y y del ADNmt |
| Propiedad de los datos | No está claro a quién pertenecen los datos | Poco claro. El cliente puede hacer destruir su muestra de saliva | Poco claro. El cliente puede eliminar / destruir ADN y datos | Tus datos te pertenecen permanentemente |
| Centrarse en la privacidad | si | No | No | Sí (Puede obtener más información en nuestro sitio web) |
| Tecnología de seguridad utilizada | Poco claro | Protocolos de seguridad estándar como SSL | Protocolos de seguridad estándar como SSL | Blockchain, informática que preserva la privacidad |
| Opciones de carga de datos | Sí, con una tarifa | No | No | Si. La imputación permite un informe ampliado |
| Actualizaciones gratuitas basadas en nuevas investigaciones | No | No | No | El informe se actualiza periódicamente(más información) |
| Herramientas para explorar datos | Ninguna | Limitado | Limitado | Si ( aprende más ) |
| Acceso a los datos | Los datos pueden descargarse, pero el formato no está claro | Sí (archivo de formato 23andMe) | Sí (archivo de formato AncestryDNA) | Sí (archivos FASTQ, BAM y VCF) |
| Costo | Varía según las necesidades individuales. Puede ser de hasta 1559 dólares | $ 99 o $ 199 | $99 o $119 | $0, $99, $299 |
Consulte más del blog para obtener más información sobre la importancia de la secuenciación. Y-DNA y mtDNA y prueba de paternidad .
¿Interesado en la secuenciación del genoma completo? Puede consultar estos otros productos:
- 24Genetics (secuenciación del genoma completo)
- Color (se dispone de secuenciación del genoma completo de baja cobertura)
- Dante Labs (secuenciación del genoma completo 30x, la mayoría de los informes están disponibles con un coste adicional)
- Genomas completos (opciones de carga de datos o pruebas para obtener un informe completo)
- Mapmygenome (sólo disponible en la India)
- PerkinElmer Genomics (WES, WGS, detección de recién nacidos y más)
- Sequencing.com (secuenciación del genoma completo)
- Veritas Genetics (secuenciación del genoma completo 30x y diagnósticos avanzados)
¿O le gustaría contribuir a la investigación genómica pero recibir una compensación? Mira nuestro Revisión de Luna DNA !
¿Te gustó nuestra revisión de YSEQ? Puedes leer más opiniones en nuestro blog, incluyendo la de YFull, que ofrece un producto similar, y consultar nuestra guía completa sobre el mejor kit de pruebas de ADN y otras pruebas caseras.
