Examen d’YSEQ – La qualité correspond-elle au prix ?

Résumé de l’examen YSEQ

YSEQ est une société de test ADN qui propose une variété de tests pour décoder le chromosome Y et d’autres parties du génome. Apprenez-en plus dans notre revue YSEQ!

Génomique des nébuleuses

Résultats
Prix
Interface

Sommaire

YSEQ utilise plusieurs produits de séquençage de nouvelle génération pour analyser l’ADN ; cependant, ils ont tendance à être plus chers que leurs concurrents et l’interface peut être difficile à naviguer.

4

7 faits tirés de notre examen YSEQ

  1. Localisation : Allemagne
  2. Services : Produits multiples de séquençage de nouvelle génération (test d’ADN du chromosome Y, ADNmt et séquençage du génome entier).
  3. Téléchargement des données : Téléchargement des données brutes d’ADN disponible
  4. Rapports : Produits de séquençage personnalisés ; pas de rapports d’interprétation de l’ADN
  5. La confidentialité : Application stricte de la confidentialité, mais ouverture à la divulgation d’informations avec votre permission ou dans d’autres circonstances pressantes.
  6. Coût : De moins de 100 $ à plus de 1 500 $.
  7. Alternatives: Génomique des nébuleuses (le séquençage du génome entier 30x le plus abordable)

Cette critique est écrite avec l’intention d’être aussi impartiale que possible. Cependant, il représente l’opinion d’un évaluateur individuel et est donc subjectif. De plus, chez Nebula Genomics, nous cherchons à éduquer le public sur les avantages du séquençage du génome entier. Des informations sur notre test ADN de séquençage du génome entier sont donc intégrées à l’examen.

1er septembre 2022

Edité par Christina Swords, Ph.D.

Avantages et inconvénients

Avantages

  • Un nombre incroyable d’options pour les tests d’ADN du chromosome Y, avec beaucoup de possibilités de personnalisation.
  • YSEQ permet d’affiner facilement l’ascendance de l’utilisateur, grâce à de nombreux tests différents.
  • Le séquençage complet du génome est disponible en option avec une couverture très élevée (50x).
  • Les utilisateurs peuvent demander leurs propres SNP et STR.

Les inconvénients

  • Les options ne sont pas aussi nombreuses pour le séquençage de l’ADNmt ou du génome complet.
  • Les coûts peuvent s’accumuler à mesure que d’autres tests de suivi sont effectués sur les mêmes données.
  • Les utilisateurs doivent faire leurs propres recherches pour interpréter les données ou payer un supplément pour des outils d’analyse d’ADN tiers.
  • Séquençage complet du génome très coûteux
  • Le site web est difficile à naviguer

introduction

YSEQ est une société de tests génétiques s’adressant directement aux consommateurs qui propose principalement des tests et des services de séquençage du chromosome Y.

Ces dernières années, l’entreprise s’est développée et propose désormais des tests d’ ADN mitochondrial (ADNmt ) et d’ADN autosomal (séquençage du génome entier). Ces techniques peuvent être utiles pour retracer des généalogies telles que l’ascendance amérindienne et africaine. Basée en Allemagne, YSEQ a été créée en 2013 par Thomas et Astrid Krahn, anciens employés de Family Tree DNA.

Avec YSEQ, les utilisateurs ont tout pouvoir pour décider des régions exactes du chromosome Y ou de l’ADNmt qu’ils souhaitent séquencer. Fidèle au slogan de la société, « YSEQ : DNA Origins Project », il s’adresse aux utilisateurs qui souhaitent mieux comprendre leur ascendance.

Si la société propose une gamme impressionnante d’options de séquençage personnalisé, cette offre ne comprend pas de rapports avec interprétation de l’ADN. Au lieu de cela, la plupart des utilisateurs doivent recourir à des services tiers, tels que YFull, pour interpréter leurs données brutes.

Obtenez votre séquençage du génome entier 30x à un coût bien inférieur à celui de YSEQ et avec un bonus supplémentaire : Nebula Genomics fournit également des mises à jour régulières basées sur les dernières découvertes scientifiques. Cliquez ici pour en savoir plus sur vous à un prix imbattable !

Comment fonctionne YSEQ?

Examen des services YSEQ: les bases des SNP, des STR et des haplogroupes

Les polymorphismes nucléotidiques simples, ou SNP, sont des différences dans les séquences d’ADN au niveau d’un seul nucléotide. Par exemple, lorsque les séquences d’ADN de deux individus diffèrent en un seul point, cela s’appelle un SNP.

D’autre part, répétitions courtes en tandem , ou STR, sont une série de séquences d’ADN répétées qui diffèrent entre les individus. Identifier le nombre de répétitions à des zones spécifiques du génome peut créer une «empreinte ADN». Cette empreinte génomique peut être utilisée pour déterminer la généalogie d’une personne.

Ensemble, les SNP et les STR sont des marqueurs qui peuvent être hérités. Une combinaison de tels marqueurs est connue sous le nom d’haplotype. Différents tests d’ADN-Y et d’ADNmt pour différents haplotypes peuvent attribuer des personnes à un « haplogroupe » spécifique. Par exemple, alors que les tests d’ADN-Y peuvent nous renseigner sur les origines paternelles, les tests d’ADNmt nous renseignent sur les lignées maternelles.

Les services offerts par YSEQ sont basés sur le test des STR et des SNP trouvés dans le chromosome Y et dans l’ADN mitochondrial. Le test peut révéler les origines ancestrales et les gènes associés aux ancêtres communs.

Vous pouvez choisir parmi de nombreux panels d’haplogroupes fixes du chromosome Y et de marqueurs STR. En outre, il existe des panels d’haplogroupes personnalisés et un nombre quasi infini de SNP personnalisés.

Une fois que les utilisateurs envoient leur ADN à YSEQ, il est stocké avec l’entreprise au cas où des analyses supplémentaires seraient nécessaires.

Tableau des prix des panels d'haplogroupes
Prix de certains panels d’haplogroupes

Examen des haplogroupes chromosomiques YSEQ Y

Vous pouvez choisir parmi 77 panneaux d’haplogroupes stricts et 179 panneaux d’haplogroupes personnalisés. Chacun représente des origines ancestrales différentes.

L’YSEQ recommande aux nouveaux utilisateurs de commander le panneau d’orientation de niveau supérieur, qui coûte 159 $ et couvre tous les haplogroupes. Dans ce panneau, YSEQ effectue plusieurs séries de tests pour déterminer votre position exacte dans l’arbre ancestral du chromosome Y.

Il détermine d’abord si vous appartenez à la catégorie M169 ou M9. Une fois ces informations disponibles, il descend dans l’arbre pour déterminer votre super-clade. Chaque super-clade correspond à différentes origines ancestrales. Par exemple, l’haplogroupe D-M174 se trouve en Asie de l’Est et dans les îles Andaman.

Les 76 autres panneaux d’haplogroupe définis sont plus spécifiques et coûtent entre 88 $ et 99 $. Là encore, les résultats antérieurs d’autres tests peuvent aider les utilisateurs à comprendre quel panel d’haplogroupes spécifiques ils souhaitent commander.

Arbre des haplogroupes du chromosome Y YSEQ
Arbre des haplogroupes du chromosome Y YSEQ

Par exemple, le panel de superclades Q est destiné aux utilisateurs dont les autres tests STR les orientent dans cette direction. L’YSEQ testera les utilisateurs pour définir les marqueurs de ce panel, puis descendra le long de l’arbre ancestral.

Détails du panneau Superclade Q, avec un diagramme d'un panneau comportant plusieurs cercles colorés en rouge. En bas, un diagramme en arbre expliquant les regroupements dans le panneau.
Panel de superclades YSEQ Q

En plus des 77 panels d’haplogroupes définis, YSEQ propose également 179 panels personnalisés qui fonctionnent de manière similaire aux recherches de familles proposées par d’autres services de test ADN.

Ces panneaux sont très spécifiques et plus chers (89 $ – 509 $). Par exemple, le panel E1a1-Z31503 Phelps est recommandé pour l’origine du nom de famille « Phelps ». De même, le panneau E1b-L1019 Goodrich est destiné aux personnes nommées Goodrich. YSEQ est une bonne option pour les généalogistes intéressés par de tels projets génographiques.

Si vous êtes particulièrement intéressé par les projets génographiques liés aux îles britanniques, vous devriez également consulter ADN vivant .

Examen des STR, SNP et panneaux du chromosome YSEQ Y

YSEQ propose 9 panels de STR combinés (25 à 99 $), 125 STR spécifiques (9,95 à 15 $) et 131 611 SNP (1 $ chacun) parmi lesquels choisir. Si un test SNP n’est pas disponible, les utilisateurs peuvent faire une demande spéciale. Comme chaque SNP correspond à un haplogroupe différent, les utilisateurs peuvent créer leur panel d’haplogroupes personnalisé pour les tests.

Cependant, ce niveau de tests personnalisables nécessite une certaine quantité de connaissances et de recherches préalables. Les utilisateurs doivent connaître l’histoire de leur famille, avoir effectué des tests préliminaires et savoir exactement quel haplogroupe ils veulent étudier.

Examen des tests ADNmt YSEQ

L’YSEQ propose 4 tests d’ADNmt. Deux tests portent sur l’hyper-variable mitochondriale région 1 (HPV1, 25 $) et région 2 (HPV2, 25 $). Les utilisateurs peuvent également tester l’ensemble de leur ADN mitochondrial (145 $) ou passer du test HPV1 ou HPV2 à l’ADN mitochondrial complet (115 $).

Il existe également 30 autres panels personnalisés d’ADNmt correspondant à des régions spécifiques de l’ADN mitochondrial (15 à 60 dollars).

Examen du séquençage complet du génome YSEQ

YSEQ propose trois niveaux de séquençage complet du génome, spécifiquement pour les chercheurs en généalogie. Lorsque l’équipe de l’YSEQ reçoit l’échantillon, elle mesure la concentration d’ADN et effectue un contrôle de qualité. Il l’envoie ensuite pour le séquençage sur une plateforme NovaSeq 6000. Enfin, à partir des fichiers FASTQ d’ADN brut, il annote tous les SNP du chromosome Y et fournit les haplogroupes d’ADNmt.

  • Séquence du génome entier 45 GBases : 579 $, fournit une couverture 15x.
  • Séquence du génome entier 90 Gbases : $929, fournit une couverture 30x
  • Séquence du génome entier 150 Gbases : $1559, fournit une couverture 50x.

YSEQ ne procède à aucune analyse médicale ou sanitaire des données ADN.

Examen des résultats du YSEQ

Bien que l’YSEQ ne procède à aucune analyse ou interprétation de l’ADN, les utilisateurs peuvent voir s’ils sont positifs ou négatifs pour les haplogroupes signalés. Les utilisateurs obtiennent également un tableau leur permettant de savoir s’ils sont ancestraux (négatifs) ou dérivés (positifs) pour les SNP.

YSEQ fournit aux utilisateurs des pages de résultats pour le séquençage du génome entier qui comprennent une liste des SNP trouvés dans les données avec leurs états ancestraux.

Les utilisateurs peuvent exporter leurs données vers des sites Web tiers (tels que YFull) s’ils souhaitent une analyse plus approfondie.

Téléchargement de vos données YSEQ

Les clients peuvent télécharger leurs données de séquençage du génome entier ou les recevoir par courrier sur une carte micro SD. Cependant, YSEQ ne fournit pas d’informations sur le téléchargement des données du chromosome Y ou de l’ADNmt et ne précise pas les formats de données.

Examen de la confidentialité YSEQ

Une fois que les utilisateurs ont envoyé leur ADN à YSEQ, celui-ci est stocké et traité à Houston, au Texas, au cas où des analyses supplémentaires seraient nécessaires. Lorsque les utilisateurs envoient un échantillon et demandent à bénéficier du service, ils consentent automatiquement à l’utilisation de leurs données à des fins de recherche et de développement internes.

La déclaration mentionne un formulaire de consentement que les utilisateurs signent pour des services spécifiques. S’il n’existe pas de formulaire de consentement pour un service particulier, la politique de confidentialité s’applique.

YSEQ assume l’entière responsabilité du maintien de la confidentialité des renseignements personnels. Toutefois, elle rend « suffisamment d’informations générales publiques pour permettre à [YSEQ] de constituer une bibliothèque de bases de données ADN utilisable à des fins généalogiques ».

Avec le consentement de l’utilisateur, ces données peuvent être utilisées à des fins de recherche biologique. Vos renseignements seront rendus anonymes, à moins que l’YSEQ ne le demande explicitement.

YSEQ dans l’actualité

En tant que société de test ADN spécialisée dans la génétique et la généalogie ancestrales, YSEQ n’a pas été particulièrement mise en avant dans l’actualité. Voici quelques articles, présentés sur les sites d’information italiens:

Autres commentaires sur l’YSEQ

L’entreprise n’a pas beaucoup d’avis de tiers en ligne. Cependant, il existe environ 250 avis générés par les clients sur son site web. Les notes vont de 1 à 5 étoiles.

Les clients qui ont donné des avis défavorables notent les longs temps d’attente. Les examinateurs supérieurs ont partagé des résultats intéressants et beaucoup ont noté qu’ils confirmaient des origines suspectes.

Génomique des nébuleuses

Nebula Genomics se distingue d’YSEQ et d’autres sociétés de tests génétiques parce qu’elle se concentre sur l’analyse approfondie des données. Cette analyse des données peut s’étendre à l’ensemble du génome et non plus à une ou deux régions d’un chromosome.

Nous voulons que vous ayez la meilleure expérience possible sur notre site web. Grâce à l’accès complet aux outils d’exploration du génome, vous pouvez analyser vos données génétiques à tout moment sans craindre de frais ou de coûts cachés. Contrairement à d’autres entreprises, nous utilisons les recherches les plus récentes pour mettre régulièrement à jour vos rapports génétiques. De plus, nos rapports contiennent bien plus qu’une simple ascendance génétique.

Moins d’effort pour vous

Qu’il s’agisse d’ascendance ou de santé, nous ferons la recherche pour vous. Notre interface intuitive vous permet de déverrouiller et de comprendre vos données ADN avec un minimum d’effort.

Avec de bonnes données, une grande responsabilité

Chez Nebula Genomics, nous comprenons et apprécions votre vie privée avant tout. La propriété et le contrôle de vos données sont uniquement entre vos mains. Si vous choisissez de partager vos données avec des chercheurs, vous pouvez choisir d’être rémunéré.

Vos données sont stockées sur des serveurs sécurisés et sont toujours cryptées. Vous pouvez en savoir plus sur l’importance de Confidentialité de l’ADN .

Plus que de simples ancêtres avec Nebula Expand

Vous avez déjà des données ADN d’autres entreprises? Vous pouvez le télécharger pour recevoir un rapport étendu de Nebula Genomics. Nos rapports fournissent plus d’informations que d’autres sociétés génétiques, qui utilisent des méthodes de génotypage de l’ADN basées sur des puces à ADN. Nous pouvons remplir les blancs à l’aide de nos modèles statistiques avancés, appelés imputation.

Au lieu d’avoir des rapports limités et statiques pour des traits génétiques individuels, nos rapports sont mis à jour régulièrement. Vous avez un accès immédiat à des centaines de traits de la bibliothèque de recherche Nebula, sans frais cachés.

Nebula Genomics 30x Séquençage du génome entier

Notre objectif a toujours été de mettre le pouvoir entre vos mains.

Les méthodes de test ADN utilisées par d’autres sociétés ne fournissent des données que sur une partie de votre génome. Ces données peuvent souvent provenir de une chromosome.

Cela signifie que vous risquez de manquer des informations précieuses. Avec notre service de séquençage du génome entier 30x, nous lisons 100 % de votre ADN. Cela représente 10 000 fois plus de données, que nous utilisons pour vous fournir un rapport détaillé.

Choisir le meilleur endroit pour votre test ADN est une décision très importante. Pour rendre la décision un peu plus facile, voici une comparaison de YSEQ, 23andMe, AncestryDNA et Nebula Genomics.

YSEQ23andMeAncestryDNAGénomique des nébuleuses
Méthode de test ADNSéquençage du chromosome Y, séquençage de l’ADNmt, séquençage du génome entier (couverture 15x-50x)GénotypageGénotypage30x WGS
Rapports ADNNon fourniUn rapport completUn rapport completUn rapport étendu et mis à jour régulièrement
Rapports d’ADN-Y, d’ADNmt et d’ascendanceOui, mais vous devez acheter l’ADNmt et l’ADN Y séparément. Les utilisateurs doivent faire leurs propres recherches. OuiOuiAnalyse approfondie de l’ascendance grâce au séquençage complet du chromosome Y et de l’ADNmt.
Propriété des donnéesIncertain à qui appartiennent les données Pas clair. Le client peut faire détruire son échantillon de salivePas clair. Le client peut supprimer / détruire l’ADN et les donnéesVos données vous appartiennent en permanence
Focus sur la confidentialitéOuiNonNonOui (Vous pouvez en savoir plus sur notre site web)
Technologie de sécurité utiliséePas clairProtocoles de sécurité standard comme SSLProtocoles de sécurité standard comme SSLBlockchain, informatique préservant la confidentialité
Options de téléchargement de donnéesOui, avec des fraisNonNonOui. L’imputation permet un rapport étendu
Mises à jour gratuites basées sur de nouvelles recherchesNonNonNonLe rapport est régulièrement mis à jour(en savoir plus).
Outils pour explorer les donnéesAucunLimitéLimitéOui ( apprendre encore plus )
Accès aux donnéesLes données peuvent être téléchargées, mais le format n’est pas clair.Oui (fichier au format 23andMe)Oui (fichier au format AncestryDNA)Oui (fichiers FASTQ, BAM et VCF)
CoûtVarie en fonction des besoins individuels. Peut aller jusqu’à 1559 $.99 $ ou 199 $.99 $ ou 119 $0 $, 99 $, 299 $

Consultez davantage le blog pour en savoir plus sur l’importance du séquençage ADN-Y et ADNmt et test de paternité .

Intéressé par le séquençage du génome entier? Vous pouvez consulter ces autres produits:

  • 24Genetics (séquençage du génome entier)
  • Couleur (séquençage du génome entier à faible couverture disponible)
  • Dante Labs (séquençage du génome entier 30x, la plupart des rapports sont disponibles moyennant un coût supplémentaire)
  • Génomes complets (options de téléchargement des données ou de test pour un rapport complet)
  • Mapmygenome (disponible uniquement en Inde)
  • PerkinElmer Genomics (WES, WGS, dépistage néonatal, etc.)
  • Sequencing.com (séquençage du génome entier)
  • Veritas Genetics (séquençage du génome entier 30x et diagnostics avancés)

Ou aimeriez-vous contribuer à la recherche génomique mais être rémunéré? Découvrez notre Examen de l’ADN de Luna !

Avez-vous aimé notre avis sur YSEQ? Vous pouvez lire d’autres avis sur notre blog, notamment celui de YFull qui propose un produit similaire, et consulter notre guide complet du meilleur kit de test ADN et d’autres tests à domicile.