7 фактов из нашего обзора земель ДНК
- Расположение: Соединенные Штаты Америки
- Продукты: Загрузка данных ДНК на сайт DNA.Land для анализа признаков и родословной
- Отчеты: DNA.Land предлагает разбивку по предкам, поиск родственников, отчеты по нескольким признакам
- Доставка отчета : отчеты о характеристиках доставляются через веб-сайт
- Стоимость: Свободный
- Конфиденциальность: намеревается использовать собранные генетические данные для научно-исследовательских проектов
- Альтернативы: Nebula Genomics (бесплатный расширенный анализ ДНК; самое доступное 30-кратное секвенирование всего генома)
Этот обзор написан с намерением быть максимально объективным. Однако он представляет собой мнение отдельного рецензента и поэтому является субъективным. Кроме того, в Nebula Genomics мы стремимся информировать общественность о преимуществах полногеномного секвенирования. Поэтому в обзор включена информация о нашем ДНК-тесте полногеномного секвенирования.
4 августа 2022 года
Содержание
Под редакцией Кристины Сордс, доктора философии.
По состоянию на 13 ноября 2021 года DNA Land больше не работает, и сайт был закрыт. Причина, указанная основателями, заключалась в том, что члены команды перешли на новую работу и сменили сферу деятельности, что сделало невозможным поддержание сайта в рабочем состоянии.
Этот пост был последний раз обновлен 30 декабря 2020 года, и некоторая информация может быть устаревшей.
Введение
Компания DNA Land была основана в 2015 году группой исследователей из Нью-Йоркского геномного центра и Колумбийского университета. В октябре 2019 года компания закрылась как сайт академического учреждения и перезапустилась как коммерческая компания.
В команду по-прежнему входят ее основатели: доктор Янив Эрлих, Дина Зелински и Ассаф Гордон. В связи со строгими правилами в отношении человеческих субъектов, она удалила все наборы данных, которые были собраны до 30 сентября 2019 года.
В 2017 году компания DNA Land стала партнером Национальной коалиции по борьбе с раком груди (NBCC), чтобы лучше понять генетический риск рака груди. Кроме того, Элрих работает с данными из DNA Land и веб-сайта Geni.com, чтобы построить самое большое в мире генеалогическое древо.
Земельная служба ДНК
Что такое Земля ДНК? Добровольцы должны создать учетную запись с логином DNA Land и подписать форму согласия из 1500 слов. Сайт полностью раскрывает риски и преимущества обмена генетическими данными без использования юридического жаргона.
На сайте собираются адреса электронной почты, геномные данные, основная демографическая информация об участнике и ближайших родственниках, а также черты характера. В нем также хранятся фенотипы путем предоставления анкет, касающихся физических признаков и состояния здоровья. Каждая анкета относится к одному признаку, и пользователи могут выбирать, какие анкеты заполнять.
Компания предлагает бесплатные услуги в качестве стимула для пользователей, загружающих необработанные данные. К ним относятся (i) отчет о составе предков, (ii) родственник, и (iii) предсказание интересных физических и оздоровительных качеств. Он также вменяет генетическую информацию, позволяя пользователям находить генетические вариации, которые не были частью исходного файла.
Компания также пообещала добавить больше уникальных функций на свой сайт.
Обзор системы отчетов о землях ДНК
Вы начинаете с загрузки данных на сайт. Когда вы загружаете свой необработанный файл ДНК, сайт предоставляет отчеты о происхождении, родственниках, признаках и вменении.
Обзор отчета о родословной компании DNA Land
Для поиска предков он использует референсную панель из более чем 6000 человек, разбитых на 40 популяций (включая коренных американцев). Программа «Ancestry» ищет сходство между составом ДНК пользователя и индивидуумов в референтных популяциях.
Отчет о происхождении дает представление о том, откуда происходят гены. Она позволяет определить этническую принадлежность и предоставляет карту местонахождения ближайших ДНК-совпадений. В дополнение к диаграммам предков предлагается карта, показывающая совпадающие референтные популяции по всему миру.
Также приводится фактическая разбивка по каждой совокупности, включенной или исключенной из отчета. Они также содержат больше информации о генетическом составе этих групп.
Обзор отчета по поиску родственников в стране ДНК
Пользователи также могут найти своих ближайших родственников после загрузки геномных данных. Сервис вычисляет сходство общей ДНК у разных родственников. В этих расчетах используется количество общих сегментов ДНК и общая длина общей ДНК для определения ваших совпадений. Отчет также включает визуализацию сегментов, которыми вы делитесь.
Обзор отчета о прогнозировании земельных признаков по ДНК
DNA Land сообщает об ассоциациях между генетическими вариантами, называемыми однонуклеотидными полиморфизмами (SNPs), и биологическими признаками. Прогнозируемые черты характера подразделяются на благополучие (хронотип, потребление кофе, образование) и физическое (цвет глаз, рост и близорукость).
Каждый отчет предсказывает признак на основе геномной информации пользователя. Он также сравнивает оценку правдоподобия с доступной информацией в базе данных.
Сначала пользователи проходят опрос, прежде чем получить результаты предсказания ДНК. Это позволяет пользователям проверять точность прогнозов, сделанных веб-сайтом.
Приведен пример анкеты:
Отчет, созданный DNA Land на основе геномных данных, состоит из трех компонентов.
Первый сегмент отчета показывает, насколько вероятно определенное состояние для пользователей на основе известных генетических вариантов. Примерами этого могут быть использование известных генетических вариантов, чтобы предположить, что вы, вероятно, жаворонок. На графике также показано, как этот прогноз сравнивается с другими пользователями.
Во-вторых, компания подробно описывает, какие генетические варианты или SNP (однонуклеотидные полиморфизмы) вносят вклад в прогнозируемую оценку признака. Также учитывается размер этого вклада. Пользователи также могут визуализировать расположение этих SNP на хромосомах, исследуя график размеров эффекта.
В-третьих, в отчете приводятся таблицы наиболее значимых SNP в анализе. Эта информация включает подробную разбивку по подтверждающим исследованиям. Это включает влияние каждого SNP и генов, в которых расположены варианты.
Эта интересная информация, полученная из данных генома, позволяет изучить генетический вклад в развитие человеческих черт. Расположение конкретных SNP может указывать на генетический вклад в признак.
Цены на землю ДНК
Все услуги, предлагаемые компанией, бесплатны. Пользователи могут получить доступ к своим отчетам в течение нескольких часов или дней после загрузки своих геномных данных. Дополнительные отчеты можно получить, заполнив короткие анкеты, которые помогают исследователям в их исследованиях.
Обзор DNA Land Privacy
Условия согласия гарантируют полную конфиденциальность личной информации пользователей, результатов индивидуальных опросов или любых загруженных пользовательских данных. Пользователи могут связывать свои профили в социальных сетях с веб-сайтом, но компания не передает эти данные.
Компания может передавать личные данные избранным партнерам, которые придерживаются разумных методов обеспечения безопасности, уважают согласие и соблюдают нормативные требования. Пользователи могут отказаться от этой опции, хотя личные данные могут быть раскрыты, если этого требует закон.
Пользователи, связавшие свои аккаунты на Geni.com (веб-сайт для создания семейных деревьев), могут найти информацию о других пользователях, имеющих связанные аккаунты.
Компания удалила сохраненные данные в академической версии, когда она стала коммерческой в 2019 году.
Земля ДНК в новостях
Компания получила широкое освещение в средствах массовой информации, в основном, до отделения от Колумбийского университета и Нью-Йоркского центра генома. Компания также опубликовала результаты своих генетических исследований с использованием данных пользователей в таких уважаемых журналах, как Nature Genetics и eLife.
- Краудсорсинговый сайт, который хочет объединить наши геномы
- Краудсорсинговая компания по перезапуску геномных ресурсов DNA Land
- Ученые надеются привлечь миллионы на Землю ДНК
В 2018 году Янив Эрлих выступил с докладом Ted talk о построении самого большого в мире семейного древа, используя информацию из DNA Land и Geni.com.
DNA Land сотрудничает с компанией Luna DNA, которая позволяет своим пользователям вносить вклад в исследования и получать за это вознаграждение. Ознакомьтесь с нашими Обзор Luna DNA !
Другие обзоры ДНК-земли
Насколько точна ДНК Land? Из нескольких веток DNA Land Reddit пользователи обнаружили, что 23andMe более надежен с точки зрения точности. Тем не менее, в целом есть положительные отзывы из-за того, что это бесплатная услуга и предоставляет уникальные генетические особенности, которые особенно интересны для специалистов по генетической генеалогии. Вот некоторые отзывы:
«Конфиденциальность пользователей лучше, чем у GEDMatch. Более удобный для пользователя. Их анализ ДНК на древность и недавность полезен для определения того, является ли человек недавним или дальним родственником.
Доктор Янив Эрлих отвечает на отзывы и принимает активное участие в работе сообщества генетической генеалогии. Просто хотелось бы, чтобы у него было больше пользователей».
«Это бесплатно, но сопоставление ДНК не очень хорошее, а база данных мала. У них есть совпадения для меня на этом сайте, которые есть и на других сайтах, но с сумасшедшими цифрами в сантиметрах «.
Существует не так много отзывов о новой коммерческой версии сайта.
Плюсы и минусы
Плюсы
- Бесплатно
- Постоянное совершенствование отчетов — более подробные и визуально привлекательные отчеты о предках
- Уникальные особенности, такие как импутация (использование статистических выводов для вывода неизвестных генотипов на основе известных) и общие генетические сегменты
- Пользователи, похоже, нашли больше родственников, чем в других компаниях по тестированию
- Пользователи чувствуют себя более связанными с проводимыми генетическими исследованиями, предоставляя свою геномную информацию
Минусы
- Малая геномная база данных
- Результаты анализа родословных и признаков оказались не такими точными по сравнению с другими компаниями, занимающимися тестированием
- Многие первоначальные пользователи нашли мало или вообще не нашли родственников.
Мы завершаем наш обзор DNA Land сравнением с Nebula Genomics и другими компаниями, занимающимися генетическим тестированием.
Земля ДНК | 23andMe | ДНК предков | Nebula Genomics | |
ДНК-тестирование | Использует файлы необработанных данных, полученные от других компаний | Используется генотипирование вместо секвенирования | Используется генотипирование вместо секвенирования | Предлагает 30-кратное секвенирование всего генома. Также предоставляется бесплатная загрузка необработанных данных ДНК |
Варианты загрузки данных | Бесплатный отчет о ДНК на основе загруженных данных | Отсутствие возможности загрузки данных | Отсутствие возможности загрузки данных | Бесплатный расширенный отчет ДНК из загруженных пользовательских данных |
Регулярно обновляемая отчетность | Нет | Нет | Нет | Да ( учить больше ) |
Глубокое происхождение (секвенирование Y-CHR и мтДНК) | Нет | Нет | Нет | Отчет о глубоком происхождении с полной Y-хромосомой и секвенированием мтДНК |
Вменение | Включает интерполяцию в отчет, обработанный на основе загруженных пользователем данных | Нет. Необходимость использования других ресурсов для вменения | Нет. Необходимость использования других ресурсов для вменения | Да. Предоставляет результаты вменения в расширенных отчетах |
Другие сайты для загрузки ДНК, которые вы создаете:
- BioStatus Health (загружает приложения для персонализированного фитнеса и питания)
- Художник ДНК (для генеалогии — первый бесплатный, для остальных доступны подписки)
- GedMatch Genesis (бесплатная загрузка ДНК и платные расширенные возможности)
- Генетический джин (бесплатно для отчетов о состоянии здоровья)
- LifeDNA (загрузка и отчеты о состоянии здоровья, набор ДНК и обновления доступны за дополнительную плату)
- LiveWello (отчеты о дисперсии и совместное использование сообществ)
- Живая ДНК (бесплатная загрузка для предков)
- MyHeritage (бесплатная загрузка для генеалогии)
- MyTrueAncestry (бесплатная загрузка для изучения своей связи с древними популяциями)
- NutraHacker (загрузка ДНК для получения отчетов об определенных состояниях здоровья)
- Silverberry Genomix (бесплатная загрузка и возможность приобретения дополнительных отчетов)
- StrateGene (подробные отчеты на основе биологических путей)
- TrueReport (персонализированная функциональная медицина)
Если у вас есть данные о секвенировании всего генома, обратите внимание на YПолный (25–49 долларов за Y-ДНК и мтДНК).
Если вас интересует родословная или генетическая генеалогия, вам также следует обратить внимание на:
- 23andMe (родословная, поиск родственников и здоровье)
- 24Genetics (различные тесты на здоровье, родословную, спорт, кожу, фармакогеномику, WES и WGS)
- Африканская родословная (различные тесты для потомков выходцев из Африки)
- AncestryDNA (родословная, поиск родственников и здоровье)
- CRI Genetics (проверка родословной до 50 поколений)
- Художник ДНК (первый профиль бесплатный, для остальных доступны подписки)
- GedMatch Genesis (бесплатная загрузка ДНК для генетической генеалогии и платные расширенные опции)
- Живая ДНК (бесплатная загрузка для предков)
- MyHeritage (тест на предков, дополнительные подписки для доступа к инструментам генеалогии)
- WeGene (для азиатского происхождения)
Также ознакомьтесь с нашими GEDmatch учебник чтобы узнать, как использовать этот мощный инструмент!
Если вы ищете домашний тест на отцовство, вам также следует прочитать наш обзор HomeDNA .
Если вы хотите сосредоточиться на материнской и/или отцовской линиях, вы можете обратиться к услугам YFull или YSeq, которые анализируют мтДНК или Y-хромосому для определения гаплотипов конкретных линий. Компания Full Genomes также предлагает секвенирование и анализ Y-хромосомы. Возможно, вам также стоит обратить внимание на тесты по этнической специфике, например, тесты ДНК африканцев.
Вам понравился наш обзор DNA Land? Ты можешь читать больше отзывов в нашем блоге и ознакомьтесь с нашими полное руководство по лучшему набору для тестирования ДНК и другим домашним тестам .