Nebula Library – Unlocking Genetic Research

biblioteca de nebulosa

Imagine seu genoma como uma orquestra. Às vezes, o som flui de apenas um instrumento, um solista talentoso que preenche sozinho a sala de concertos. Porém, mais frequentemente, a música é um amálgama de muitos instrumentos diferentes, cada um dando uma pequena contribuição para a melodia geral. Hoje, a pesquisa genética procura descobrir como uma orquestra de genes determina várias características e como as doenças ocorrem se essa orquestra estiver desafinada.

Os cerca de 20.000 genes do genoma funcionam de maneira semelhante. Uma determinada característica ou doença pode ser o trabalho de um único gene – por exemplo, tipo de sangue e fibrose cística. Mas as doenças e características mais comuns, como doenças cardíacas, diabetes, altura e inteligência, são o resultado de vários genes funcionando em combinação. Na verdade, centenas, mesmo milhares de genes podem trabalhar juntos, cada um exercendo uma leve influência na biologia humana. Hoje, os cientistas estão conduzindo pesquisas genéticas para melhor dissecar essas características poligênicas – ou seja, quais genes e variações genéticas (principalmente polimorfismos de nucleotídeo único) contribuem e com quanto?

Nebula Library – Pesquisa Genética Desbloqueada

Na Nebula Genomics, estamos comprometidos em trazer descobertas científicas de ponta para nossos usuários, bem como tornar seu significado mais intuitivo de entender. Temos o prazer de anunciar o lançamento da Nebula Research Library – uma coleção atualizada semanalmente de relatórios personalizados com base nas últimas descobertas genéticas. A Nebula Research Library é a parte central de nosso relatório. Com ele, você poderá se manter atualizado com as últimas descobertas da genômica humana e como elas podem se relacionar com você. Hoje, a Nebula Library inclui mais de 150 estudos de associação do genoma (GWAS). Disponibilizamos o conteúdo da Nebula Library publicamente em nosso blog para facilitar a exploração e descoberta de conteúdo de seu interesse.

Nesta postagem do blog, vamos explicar como usar a Nebula Research Library e entender os resultados dos estudos de associação do genoma que ela contém.

Pesquisa Genética Explicada

A Figura 1 mostra uma entrada de biblioteca exemplar – um estudo de associação de todo o genoma que examinou a genética do transtorno de déficit de atenção e hiperatividade (TDAH). Primeiro, você verá o título de um artigo de pesquisa, junto com a data de publicação, o autor principal, o nome e o periódico de publicação. À direita do título do artigo, você pode encontrar um botão de compartilhamento que pode ser usado para compartilhar seus resultados por e-mail ou nas redes sociais. Abaixo do título, há tags de tópicos que o ajudarão a explorar a Nebula Research Library para conteúdo relacionado.

A seguir, fornecemos um resumo do estudo, juntamente com algumas informações adicionais que são relevantes para a condição estudada. No exemplo de estudo abaixo, explicamos o que é TDAH e fornecemos algumas informações sobre como o estudo foi conduzido. Por exemplo, o número de participantes do estudo e sua etnia.

Pontuações poligênicas

Calculamos dois números para a maioria dos estudos. O primeiro número é uma pontuação poligênica. Ele resume o efeito de todas as variantes genéticas descobertas no estudo e presentes em seu genoma. O segundo número é um percentil calculado para a pontuação poligênica. Ele mostra como sua pontuação poligênica se compara às pontuações de outros usuários do Nebula Genomics.

A Figura 1 mostra uma pontuação poligênica para transtorno de déficit de atenção e hiperatividade (TDAH) que foi calculada a partir de variantes associadas ao TDAH identificadas neste estudo (UMA). Esta pontuação coloca o usuário no 97º percentil (B), o que significa que ele tem uma pontuação poligênica maior para TDAH do que 97% de nossos usuários.

Um estudo genético na nova Nebula Research Library.

Figura 1. Uma entrada na nova Biblioteca de Pesquisa de Nebulosa.

Informação Genética Detalhada

Abaixo da pontuação poligênica, você pode encontrar uma tabela com variantes genéticas. As duas primeiras colunas da tabela contêm os IDs das variantes e os alelos – versões de uma variante – que foram encontradas associadas a um traço ou doença, que é o TDAH no exemplo da Figura 1 (C).

Em seguida, vêm três colunas que listam os tamanhos dos efeitos dos alelos, frequências e significância estatística das associações (D). Os tamanhos de efeito são as contribuições de diferentes alelos para a pontuação poligênica. Alguns alelos têm tamanhos de efeito positivos e aumentam a pontuação (destacados em verde), enquanto outros alelos têm tamanhos de efeitos negativos e diminuem a pontuação (destacados em azul). Os alelos não presentes em seu genoma não afetam sua pontuação poligênica (não destacado). A próxima coluna contém frequências de alelos que informam a porcentagem de pessoas na população que carregam cada um dos alelos listados. Também mostramos significância estatística para cada uma das associações descobertas em um estudo. Esses números são chamados p -valores. Quanto menor o p -valor, mais certo é que a associação descoberta entre um traço e uma variante genética é real.

A última coluna mostra seu genótipo – os dois alelos que você herdou de seus pais – e uma precisão estimada de nossa previsão (E). Observe que consideramos essa incerteza ao calcular suas pontuações poligênicas. Se a precisão for baixa, a contribuição para a pontuação poligênica é reduzida.

Prossiga com cuidado

Gostaríamos de enfatizar que os escores que calculamos não devem ser considerados escores de risco genético e não devem ser usados para prever o risco de desenvolver doenças. Existem várias limitações.

Primeiro, os escores poligênicos descrevem apenas predisposições genéticas. As influências de fatores ambientais, como estilo de vida, não são consideradas. Em segundo lugar, a herdabilidade genética da maioria das características e doenças permanece mal compreendida. Os estudos na Nebula Library listam apenas as associações mais significativas, que são apenas uma pequena fração de todas as ligações existentes entre genética e características. As variantes identificadas também não são necessariamente as variantes causais. Terceiro, a maioria dos estudos examinou dados genéticos de indivíduos de ascendência europeia. Se as mesmas associações existem em outras populações e podem ser usadas para a previsão de risco, muitas vezes permanece uma questão em aberto. Grandes projetos de genômica populacional como o UK Biobank estão em andamento para responder a essa pergunta.

Por essas razões, a Nebula Research Library não se destina ao uso médico ou diagnóstico. Os genes não são necessariamente o destino. Se você tiver uma variante específica associada a uma doença em seu genoma, não significa que desenvolverá essa doença. O mesmo vale para pontuações poligênicas. Um alto índice / percentil poligênico para uma doença específica não significa necessariamente um risco de doença significativamente aumentado. Como sempre, se você tiver alguma dúvida sobre sua saúde, peça o conselho e a opinião de um profissional de saúde.

Junte-se a nós hoje

O sequenciamento do genoma pessoal tornou-se acessível a quase todos. Agora você pode entrar na era da genômica pessoal e aprender como as últimas descobertas se relacionam com o seu DNA. Solicite nosso sequenciamento de genoma completo ou comece gratuitamente enviando seus dados 23andMe / AncestryDNA !

Relatórios na Biblioteca de Nebulosa (agosto de 2020)